RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464263.1

RAB11FIP3-208, Transcript of RAB11 family interacting protein 3, human

TSL 3

Gene RAB11FIP3, Length 329 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MED29	Q9NX70	200 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KLF4	O43474	513 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RNF13	O43567	381 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SLC43A1	O75387	559 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	GOSR1	O95249	250 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	HRG	P04196	525 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MPG	P29372	298 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	AQP2	P41181	271 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MAGEA2	P43356	314 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RASSF2	P50749	326 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SMIM11A	P58511	58 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SEC23B	Q15437	767 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TAB1	Q15750	504 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	OR52J3	Q8NH60	311 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	BOD1	Q96IK1	185 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	LRR1	Q96L50	414 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ZNF347	Q96SE7	839 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CIB4	A0PJX0	185 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	OR5H1	A6NKK0	313 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	AQP12B	A6NM10	295 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RAD51D	O75771	328 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SERPINI2	O75830	405 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	GADD45G	O95257	159 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	IFNGR1	P15260	489 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	OMP	P47874	163 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	BID	P55957	195 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	FGD3	Q5JSP0	725 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RRM2B	Q7LG56	351 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CDK20	Q8IZL9	346 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	OR6X1	Q8NH79	312 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	LRGUK	Q96M69	825 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	POMP	Q9Y244	141 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ZNF726	A6NNF4	738 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CDC42EP2	O14613	210 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KRT33A	O76009	404 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	STAMBP	O95630	424 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	F13B	P05160	661 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RRM2	P31350	389 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	GPR4	P46093	362 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	LIMS1	P48059	325 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SLC9A3	P48764	834 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	HMGA2	P52926	109 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SPIB	Q01892	262 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CHRNB3	Q05901	458 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CAMK2D	Q13557	499 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CARD17	Q5XLA6	110 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	OAF	Q86UD1	273 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	WDR31	Q8NA23	367 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	LURAP1	Q96LR2	239 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	GPR35	Q9HC97	309 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	INIP	Q9NRY2	104 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ABCA4	P78363	2273 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TACC2	O95359	2948 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RAB11FIP3-208	ENST00000464263		A0A1W2PPR1	153 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PTP4A3	O75365	173 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KRT36	O76013	467 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CBX1	P83916	185 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TGFBR3	Q03167	851 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	STK11	Q15831	433 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms