RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF726A6NNF4 738 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 SEC14L2O76054 403 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 PAX1P15863 534 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 FABP6P51161 128 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 AGAP6Q5VW22 663 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 ANKRD16Q6P6B7 361 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 FBXL14Q8N1E6 418 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 MPP4Q96JB8 637 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 DHRS9Q9BPW9 319 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 PCDHAC1Q9H158 963 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 NANSQ9NR45 359 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 CMTM6Q9NX76 183 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 MOKQ9UQ07 419 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 SLC35F4A4IF30 521 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 OVOL3O00110 214 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 CD8AP01732 235 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 KDELR2P33947 212 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 CAMK2DQ13557 499 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF74Q16587 644 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 PHYHD1Q5SRE7 291 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 ARPINQ7Z6K5 226 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 BIVMQ86UB2 503 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 TMEM123Q8N131 208 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 LRRC17Q8N6Y2 441 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 KCNS3Q9BQ31 491 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 OBP2BQ9NPH6 170 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 RNF13O43567 381 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 HIST1H2ABP04908 130 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 TTKP33981 857 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 CAPZA2P47755 286 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 TREML1Q86YW5 311 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 OR6N1Q8NGY5 312 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 HIST1H2ACQ93077 130 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 SLC38A2Q96QD8 506 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 GSTA4O15217 222 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 NUDT2P50583 147 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 SLC7A2P52569 658 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 LIPEQ05469 1076 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 CLEC9AQ6UXN8 241 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 PXKQ7Z7A4 578 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 DTX2Q86UW9 622 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 NKAIN4Q8IVV8 208 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 WDFY1Q8IWB7 410 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 SLC15A3Q8IY34 581 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 C20orf196Q8IYI0 205 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 MUC15Q8N387 334 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 HS6ST2Q96MM7 605 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 PRSS27Q9BQR3 290 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 NELFAQ9H3P2 528 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 EFCAB1Q9HAE3 211 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 RIMS3Q9UJD0 308 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 AP3M1Q9Y2T2 418 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 NDUFS7O75251 213 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 IFNGR1P15260 489 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 BIDP55957 195 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 CLEC12BQ2HXU8 276 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 PFN4Q8NHR9 129 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 TMEM255BQ8WV15 326 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 BOD1Q96IK1 185 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 CACNG6Q9BXT2 260 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 SLC19A3Q9BZV2 496 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 C2CD3Q4AC94 2353 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 UGT2B15P54855 530 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 CPLX4Q7Z7G2 160 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 ANKK1Q8NFD2 765 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 COX4I2Q96KJ9 171 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF426Q9BUY5 554 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 ULBP2Q9BZM5 246 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 CBLN4Q9NTU7 201 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF229Q9UJW7 825 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 POFUT2Q9Y2G5 429 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 NF1P21359 2839 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 OR5F1O95221 314 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF682O95780 498 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 IGHV4-39P01824 125 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 ACVR1BP36896 505 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 GYS2P54840 703 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 MELKQ14680 651 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 SLC35D2Q76EJ3 337 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 LZICQ8WZA0 190 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms