RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2AT4A6NND4 320 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 B3GAT3O94766 335 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV2-5P01817 119 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 MT-ND5P03915 603 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 GKN3PP0CG01 181 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 NME1P15531 152 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 AGAP20933 346 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ADH6P28332 368 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PYCR1P32322 319 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 SPAM1P38567 509 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PLA2G5P39877 138 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR4P46093 362 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 HTR5AP47898 357 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 OR12D2P58182 307 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2B8PP59922 312 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 SPCS3P61009 180 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 DHCR24Q15392 516 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PYY3Q5JQD4 70 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 C10orf120Q5SQS8 335 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM69Q5SWH9 247 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 FIGNL1Q6PIW4 674 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 OR1J4Q8NGS1 313 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 S100PBPQ96BU1 408 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 BBS4Q96RK4 519 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 NDC1Q9BTX1 674 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 TOLLIPQ9H0E2 274 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PCED1AQ9H1Q7 454 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC35D1Q9NTN3 355 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 MARCH2Q9P0N8 246 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF337Q9Y3M9 751 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 KMT2EQ8IZD2 1858 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PPIHO43447 177 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 CLDN7O95471 211 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 TGFB1P01137 390 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 TACR2P21452 398 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ITGA3P26006 1051 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 AVPR2P30518 371 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 AGTR1P30556 359 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 DLSTP36957 453 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PTH2RP49190 550 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 MECP2P51608 486 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 RPS15P62841 145 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 RPS24P62847 133 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 TAF13Q15543 124 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 POMGNT2Q8NAT1 580 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 STOML3Q8TAV4 291 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 NUBPLQ8TB37 319 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 C16orf78Q8WTQ4 265 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ASB11Q8WXH4 323 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 AUTS2Q8WXX7 1259 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 CXorf40BQ96DE9 158 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PGLYRP3Q96LB9 341 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF607Q96SK3 696 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC6A16Q9GZN6 736 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 CHRDQ9H2X0 955 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ACKR4Q9NPB9 350 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 POT1Q9NUX5 634 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 DOCK6Q96HP0 2047 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 C9orf170A2RU37 121 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 OR5H14A6NHG9 310 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 F5H5T6 163 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 J3QRE1 110 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNAB3O43448 404 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 C8GP07360 202 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 UQCRC2P22695 453 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 RAC3P60763 192 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 TSPAN31Q12999 210 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 OR7A5Q15622 319 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 LILRA6Q6PI73 481 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 C15orf54Q8N8G6 183 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 OR10R2Q8NGX6 335 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ISOC2Q96AB3 205 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PHYHIPLQ96FC7 376 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP6V0BQ99437 205 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 NRIP2Q9BQI9 281 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 A4GALTQ9NPC4 353 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 MIEF1Q9NQG6 463 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP23Q9Y6H3 246 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1W2PRV1 198 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 EPOPA6NHQ4 379 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 AP4M1O00189 453 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 KDELR3O43731 214 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 KLK1P06870 262 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 RHOP08100 348 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 IL3P08700 152 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 GABRR2P28476 465 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC11A1P49279 550 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 TAS2R41P59536 307 aa7.69□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms