RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389759.7

PKP4-202, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKP4, Length 4,443 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-202ENST00000389759 TPPPO94811 219 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 S100A8P05109 93 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 CTSAP10619 480 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 CPT2P23786 658 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 ZNF136P52737 540 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 LIPNQ5VXI9 398 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 ABHD17CQ6PCB6 329 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 MDGA2Q7Z553 956 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 C7orf61Q8IZ16 206 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 PRR22Q8IZ63 422 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 ANKRD53Q8N9V6 530 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 OR1M1Q8NGA1 313 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 YIPF5Q969M3 257 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 MIB2Q96AX9 1013 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 DDIT4LQ96D03 193 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 RAB3CQ96E17 227 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 TIMM29Q9BSF4 260 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 TMEM59Q9BXS4 323 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 SLC25A31Q9H0C2 315 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 ZNF160Q9HCG1 818 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 DOT1LQ8TEK3 1739 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 SLC5A10A0PJK1 596 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 AIPO00170 330 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 TACR3P29371 465 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 EPHA5P54756 1037 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 ACY1Q03154 408 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 RUNX3Q13761 415 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 SSX1Q16384 188 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 RTL6Q6ICC9 239 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 TMEM88Q6PEY1 159 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 CMTM4Q8IZR5 234 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 MMP21Q8N119 569 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 LSMEM1Q8N8F7 131 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 OR52H1Q8NGJ2 320 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 OR1S1Q8NH92 325 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 SMIM4Q8WVI0 70 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 GIMAP5Q96F15 307 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 CASD1Q96PB1 797 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 APOOQ9BUR5 198 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 POFUT1Q9H488 388 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 C1orf123Q9NWV4 160 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 KPTNQ9Y664 436 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 PKD1L3Q7Z443 1732 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 TRIM77I1YAP6 450 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 PRPH2P23942 346 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 HOXA9P31269 272 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 CRYBB2P43320 205 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 MAGEB1P43366 347 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 CSNK1G2P78368 415 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 MEP1BQ16820 701 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 SLC35D3Q5M8T2 416 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 FAM27D1Q5T7N8 215 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 FBXW12Q6X9E4 464 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP7.99□□□□□ -1.131e-6■■■■□ 26.6
PKP4-202ENST00000389759 RHOUQ7L0Q8 258 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 KCNRGQ8N5I3 272 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 MFSD9Q8NBP5 474 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 PLPP7Q8NBV4 271 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 OR56B1Q8NGI3 324 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 WFDC5Q8TCV5 224 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 TMED6Q8WW62 240 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 Q96M85 177 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 MARVELD1Q9BSK0 173 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 TAS2R5Q9NYW4 299 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 HCSTQ9UBK5 93 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 CPNE7Q9UBL6 633 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 LRP5O75197 1615 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 OR5H14A6NHG9 310 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 IFITM5A6NNB3 132 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 NUDT19A8MXV4 375 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 B3GALNT1O75752 331 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 GLCEO94923 617 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 ETHE1O95571 254 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 ITGB2P05107 769 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 GABRR1P24046 479 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 IHHQ14623 411 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 FAAP20Q6NZ36 180 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 BBS1Q8NFJ9 593 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 OR5L2Q8NGL0 311 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 MCOLN1Q9GZU1 580 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 MCCC2Q9HCC0 563 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 BCL2L10Q9HD36 194 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PKP4-202ENST00000389759 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms