RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF432O94892 652 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 GZMBP10144 247 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 CPN1P15169 458 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 DUSP1P28562 367 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 TNFSF8P32971 234 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 OSTNP61366 133 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 HSF1Q00613 529 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 B4GALNT1Q00973 533 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 PRR31Q5SQ13 230 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM240Q5SV17 173 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 CARD17Q5XLA6 110 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 KDM8Q8N371 416 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 HMGB4Q8WW32 186 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 ISOC2Q96AB3 205 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 BPIFA2Q96DR5 249 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 SMPD4Q9NXE4 827 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A0C4DFX4 3053 aa6.23□□□□□ -1.41
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RABGEF1-202ENST00000380828 UPK3BL2E5RIL1 263 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 OR6A2O95222 327 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 IGSF6O95976 241 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 LAMP2P13473 410 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 CD27P26842 260 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 CERS1P27544 350 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 MNDAP41218 407 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 TAS2R38P59533 333 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 MAMLD1Q13495 774 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 SPRYD7Q5W111 196 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 TMPPEQ6ZT21 453 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 NHLRC2Q8NBF2 726 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 NRGNQ92686 78 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 ALG9Q9H6U8 611 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 PRODH2Q9UF12 536 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 POMT2Q9UKY4 750 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 OAZ3Q9UMX2 235 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 A4GNTQ9UNA3 340 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 MMP24Q9Y5R2 645 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 PRORSD1PA6NEY8 169 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 B3GALT2O43825 422 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 C1QAP02745 245 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 SPARCP09486 303 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 BMP3P12645 472 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 NCK1P16333 377 aa6.23□□□□□ -1.41
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RABGEF1-202ENST00000380828 ACKR3P25106 362 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 ETV6P41212 452 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 TTPAP49638 278 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 CEACAM21Q3KPI0 293 aa6.23□□□□□ -1.41
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RABGEF1-202ENST00000380828 XYLT1Q86Y38 959 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 OR6V1Q8N148 313 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 RNFT2Q96EX2 444 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 SCRN2Q96FV2 425 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 AGPAT1Q99943 283 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 RTN4RQ9BZR6 473 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 DOK5Q9P104 306 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 PDE10AQ9Y233 779 aa6.23□□□□□ -1.41
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RABGEF1-202ENST00000380828 RAP2CQ9Y3L5 183 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM227AF5H4B4 570 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 RAD17O75943 681 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 GJB5O95377 273 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 PSMB9P28065 219 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 TMPRSS3P57727 454 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 S100A10P60903 97 aa6.23□□□□□ -1.41
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RABGEF1-202ENST00000380828 TEX38Q6PEX7 206 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC16A9Q7RTY1 509 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC44A3Q8N4M1 653 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 OR4S2Q8NH73 311 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 RAD54LQ92698 747 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 ADGRG7Q96K78 797 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 SELENOIQ9C0D9 397 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 PADI3Q9ULW8 664 aa6.23□□□□□ -1.41
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