RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 PGDP52209 483 aa12.05□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 C1orf61Q13536 156 aa12.05□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 POMGNT2Q8NAT1 580 aa12.05□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 HMGB4Q8WW32 186 aa12.05□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 ZNRF4Q8WWF5 429 aa12.05□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 LRRC46Q96FV0 321 aa12.05□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 HSPA12BQ96MM6 686 aa12.05□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 ORAI3Q9BRQ5 295 aa12.05□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 ACTR6Q9GZN1 396 aa12.05□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 LRIT1Q9P2V4 623 aa12.05□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 OR10H1Q9Y4A9 318 aa12.05□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 PSMD9O00233 223 aa12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 ABCD4O14678 606 aa12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 RP2O75695 350 aa12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 ADRB1P08588 477 aa12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 RAD52P43351 418 aa12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 GPR143P51810 404 aa12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 DEFA5Q01523 94 aa12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 SLC25A25Q6KCM7 469 aa12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM92Q6UXU6 159 aa12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 NHLRC1Q6VVB1 395 aa12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 LURAP1LQ8IV03 231 aa12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 SYS1Q8N2H4 156 aa12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 OR8K3Q8NH51 312 aa12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 ORAI1Q96D31 301 aa12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 Q9N2J8 555 aa12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 FAM171A2A8MVW0 826 aa12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 ARPC5O15511 151 aa12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 TGM6O95932 706 aa12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 GRPRP30550 384 aa12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 ERVK-25P63136 954 aa12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 HYAL1Q12794 435 aa12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 SLC22A10Q63ZE4 541 aa12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 LINC00114Q6XXX2 140 aa12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 SLC43A2Q8N370 569 aa12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 GPBAR1Q8TDU6 330 aa12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 NCDNQ9UBB6 729 aa12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF69Q9UC07 566 aa12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 A0A1B0GVT2 93 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 FAM221BA6H8Z2 402 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 D6RAR5 112 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 TGFBR3LH3BV60 316 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 UCHL1P09936 223 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 CTSEP14091 401 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 S100A11P31949 105 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 GDNFP39905 211 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 DIO1P49895 249 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 HHEXQ03014 270 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 HES5Q5TA89 166 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 NPSR1Q6W5P4 371 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 C10orf53Q8N6V4 93 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 OR4C3Q8NH37 302 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 OR14A16Q8NHC5 309 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 ZPLD1Q8TCW7 415 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 RASD2Q96D21 266 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 VSTM2LQ96N03 204 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 DGAT2Q96PD7 388 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 NRIP3Q9NQ35 241 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 ICAM5Q9UMF0 924 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 RCE1Q9Y256 329 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 KNL1Q8NG31 2342 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 IDSB3KWA1 339 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 SDC3O75056 442 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 IFI6P09912 130 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 RNH1P13489 461 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 SPI1P17947 270 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 BTG2P78543 158 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF141Q15928 474 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 PDSS1Q5T2R2 415 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 METTL11BQ5VVY1 283 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 TMUB2Q71RG4 321 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 OVCH1Q7RTY7 1134 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 PDZD9Q8IXQ8 264 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 GATSQ8NAP1 163 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 AVL9Q8NBF6 648 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-202ENST00000375175 NPEPL1Q8NDH3 523 aa12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms