RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 PM20D2Q8IYS1 436 aa13.8□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 OR6V1Q8N148 313 aa13.8□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 GALNT16Q8N428 558 aa13.8□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 RFLNBQ8N5W9 214 aa13.8□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 ACBD7Q8N6N7 88 aa13.8□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 ZFP41Q8N8Y5 198 aa13.8□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF511Q8NB15 262 aa13.8□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 CLEC1AQ8NC01 280 aa13.8□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 OR6K6Q8NGW6 343 aa13.8□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 OR6S1Q8NH40 331 aa13.8□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 NDNFQ8TB73 568 aa13.8□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 TXNDC15Q96J42 360 aa13.8□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 TTTY10Q9BZA0 68 aa13.8□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 TXNIPQ9H3M7 391 aa13.8□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 RERGLQ9H628 205 aa13.8□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 HAO2Q9NYQ3 351 aa13.8□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 TEKT2Q9UIF3 430 aa13.8□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 SPTBN2O15020 2390 aa13.8□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa13.79□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 A0A087WZY1 265 aa13.79□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa13.79□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 DAPL1A0PJW8 107 aa13.79□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 LRRC3CA6NJW4 275 aa13.79□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF814B7Z6K7 855 aa13.79□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 CCRL2O00421 344 aa13.79□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 AIREO43918 545 aa13.79□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 SELENOFO60613 162 aa13.79□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 TFP02787 698 aa13.79□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 CNR1P21554 472 aa13.79□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 PEX19P40855 299 aa13.79□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 OR2B6P58173 313 aa13.79□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF85Q03923 595 aa13.79□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 TLE3Q04726 772 aa13.79□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 TMED1Q13445 227 aa13.79□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 LINC01590Q5TEZ4 76 aa13.79□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 RAET1LQ5VY80 246 aa13.79□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 SSX6Q7RTT6 188 aa13.79□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 ZBTB46Q86UZ6 589 aa13.79□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa13.79□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 NXPE2Q96DL1 559 aa13.79□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa13.79□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 RACGAP1Q9H0H5 632 aa13.79□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 SYT4Q9H2B2 425 aa13.79□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 CHST11Q9NPF2 352 aa13.79□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 DCDC2BA2VCK2 349 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 RFC3P40938 356 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 MAP2K6P52564 334 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 NHLH1Q02575 133 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 PUDPQ08623 228 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 ZP4Q12836 540 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 SELENBP1Q13228 472 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 OR1C1Q15619 314 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 EMC4Q5J8M3 183 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 OTPQ5XKR4 325 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 GPR139Q6DWJ6 353 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 C19orf48Q6RUI8 117 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 IGF2-ASQ6U949 168 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF519Q8TB69 540 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 FOXN4Q96NZ1 517 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 CENPOQ9BU64 300 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 ALG12Q9BV10 488 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 ALG8Q9BVK2 526 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 CORINQ9Y5Q5 1042 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 TRABD2BA6NFA1 517 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 H0YC42 278 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 RAMP1O60894 148 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 GPX5O75715 221 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 GLCEO94923 617 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 IFNGR1P15260 489 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 FOXO1Q12778 655 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 C1DQ13901 141 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 ARMC4Q5T2S8 1044 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 KLBQ86Z14 1044 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 KLHL36Q8N4N3 616 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF248Q8NDW4 579 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 JAM3Q9BX67 310 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 NUAK2Q9H093 628 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 MED29Q9NX70 200 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 ALKBH4Q9NXW9 302 aa13.78□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 CACNA1CQ13936 2221 aa13.77□□□□□ -0.2
CASQ1-201ENST00000368078 TVP23AA6NH52 213 aa13.77□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 TRAPPC6AO75865 159 aa13.77□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 P2RY4P51582 365 aa13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms