RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 TXNDC15Q96J42 360 aa15.9■□□□□ 0.14
LTV1-201ENST00000367576 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa15.9■□□□□ 0.14
LTV1-201ENST00000367576 NPIPA1Q9UND3 350 aa15.9■□□□□ 0.14
LTV1-201ENST00000367576 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa15.9■□□□□ 0.14
LTV1-201ENST00000367576 CACNA1AO00555 2505 aa15.9■□□□□ 0.14
LTV1-201ENST00000367576 A0A1W2PNV4 684 aa15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 SH3D21A4FU49 640 aa15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 LINC01387J3KSC0 135 aa15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 ARHGEF9O43307 516 aa15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 IDH3BO43837 385 aa15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 DBTP11182 482 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 APEHP13798 732 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 PAICSP22234 425 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 SLC16A1P53985 500 aa15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 RPS7P62081 194 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 APOFQ13790 326 aa15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 C1DQ13901 141 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 MEDAGQ5VYS4 303 aa15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 SLC35D2Q76EJ3 337 aa15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 SHFQ7M4L6 423 aa15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 UEVLDQ8IX04 471 aa15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 NPEPL1Q8NDH3 523 aa15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 OR51L1Q8NGJ5 315 aa15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 ROBO4Q8WZ75 1007 aa15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 TXNIPQ9H3M7 391 aa15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 OR6C68A6NDL8 312 aa15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 PRODHO43272 600 aa15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 TXNDC12O95881 172 aa15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 ZNF708P17019 499 aa15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 GABARAPL2P60520 117 aa15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 SLC35A2P78381 396 aa15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 RUNX1T1Q06455 604 aa15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 SLC25A30Q5SVS4 291 aa15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 NXNL2Q5VZ03 156 aa15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 GPR139Q6DWJ6 353 aa15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 MEIOBQ8N635 442 aa15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 ZNF519Q8TB69 540 aa15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 PTP4A1Q93096 173 aa15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 COPS4Q9BT78 406 aa15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 EMC6Q9BV81 110 aa15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 RERGLQ9H628 205 aa15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa15.89■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 CLCA1A8K7I4 914 aa15.88■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 XKRYO14609 159 aa15.88■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 IGHMP01871 453 aa15.88■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 MT-ND2P03891 347 aa15.88■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 STSP08842 583 aa15.88■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 BIDP55957 195 aa15.88■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 RAC3P60763 192 aa15.88■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 MVKQ03426 396 aa15.88■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 LINC00303Q3SY05 128 aa15.88■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa15.88■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 PXKQ7Z7A4 578 aa15.88■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 ASB10Q8WXI3 467 aa15.88■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 RNFT2Q96EX2 444 aa15.88■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 TSSK2Q96PF2 358 aa15.88■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 TRIM64A6NGJ6 449 aa15.87■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 FAM171A2A8MVW0 826 aa15.87■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 BCL10O95999 233 aa15.87■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 ACTL6AO96019 429 aa15.87■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 PYCR1P32322 319 aa15.87■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 DAP3P51398 398 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 H3F3AP84243 136 aa15.87■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 EMC4Q5J8M3 183 aa15.87■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 PDSS1Q5T2R2 415 aa15.87■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 ARMC4Q5T2S8 1044 aa15.87■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa15.87■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 VASNQ6EMK4 673 aa15.87■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 ZNF773Q6PK81 442 aa15.87■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa15.87■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 GID4Q8IVV7 300 aa15.87■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 PM20D2Q8IYS1 436 aa15.87■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 STX19Q8N4C7 294 aa15.87■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 OXGR1Q96P68 337 aa15.87■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 DUSP21Q9H596 190 aa15.87■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 TAS2R16Q9NYV7 291 aa15.87■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 CAMK2AQ9UQM7 478 aa15.87■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 NOX1Q9Y5S8 564 aa15.87■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 A0A087WXM4 84 aa15.87■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 CCDC182A6NF36 153 aa15.87■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 RGS10O43665 173 aa15.87■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 ADRA2AP08913 450 aa15.87■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 ZNF43P17038 809 aa15.87■□□□□ 0.13
LTV1-201ENST00000367576 MAP2K4P45985 399 aa15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms