RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364926.1

RNU6-392P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 392, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-392P, Length 101 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-392P-201ENST00000364926 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 CLK3P49761 638 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 DIO1P49895 249 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 RAB13P51153 203 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 CCR4P51679 360 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 MVDP53602 400 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 PLA2G16P53816 162 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 WDR4P57081 412 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 CORO7P57737 925 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 CLRN1P58418 232 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 KRTAP10-1P60331 282 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 PSG6Q00889 435 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 PMS2P3Q13401 168 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 NAE1Q13564 534 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 TFDP2Q14188 446 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 CSHL1Q14406 222 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 TRADDQ15628 312 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 OASLQ15646 514 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 CHI3L2Q15782 390 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 TBCCQ15814 346 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 TSTQ16762 297 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 GSG1Q2KHT4 349 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 TTLL9Q3SXZ7 439 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 RNF212Q495C1 297 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 SPRNQ5BIV9 151 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 FBXO48Q5FWF7 155 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 C9orf135Q5VTT2 229 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 AP1ARQ63HQ0 302 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 C18orf63Q68DL7 685 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 PVRIGQ6DKI7 326 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 C3orf33Q6P1S2 294 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 LRIG3Q6UXM1 1119 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 CASP12Q6UXS9 341 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 ACP7Q6ZNF0 438 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 MICALCLQ6ZW33 695 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 DPPA2Q7Z7J5 298 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 MARCH3Q86UD3 253 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 HAPLN4Q86UW8 402 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 GPR180Q86V85 440 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 RNF130Q86XS8 419 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 MAP7D3Q8IWC1 876 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 CTAGE4Q8IX94 777 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 CMTM4Q8IZR5 234 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 ZNF567Q8N184 647 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 C6orf223Q8N319 242 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 PRELID2Q8N945 189 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 PDPRQ8NCN5 879 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 OR4N2Q8NGD1 307 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 OR4K5Q8NGD3 323 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 OR4L1Q8NH43 312 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 UBALD1Q8TB05 177 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 RPS4Y2Q8TD47 263 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 MAIP1Q8WWC4 291 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 C11orf40Q8WZ69 217 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 EXT2Q93063 718 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 FBXL8Q96CD0 374 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 LRRC39Q96DD0 335 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 MS4A3Q96HJ5 214 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 LYZL4Q96KX0 146 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 RNF157Q96PX1 679 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 OR5M11Q96RB7 305 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 USP28Q96RU2 1077 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 ZNF382Q96SR6 550 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 DNAJC7Q99615 494 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 EGFL8Q99944 293 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 KLHDC3Q9BQ90 382 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 CRACR2AQ9BSW2 395 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 PTDSS2Q9BVG9 487 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 MS4A8Q9BY19 250 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 BCL2L14Q9BZR8 327 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 SLC19A3Q9BZV2 496 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 NDEL1Q9GZM8 345 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 PARVBQ9HBI1 364 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 SMURF1Q9HCE7 757 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 RLIMQ9NVW2 624 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 PTTG2Q9NZH5 202 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 FLRT3Q9NZU0 649 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 UPB1Q9UBR1 384 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-392P-201ENST00000364926 IL19Q9UHD0 177 aa0.99□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms