RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 GIPP09681 153 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 PGDP52209 483 aa16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 SCAND1P57086 179 aa16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 TAS2R20P59543 309 aa16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 RAB14P61106 215 aa16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 DHODHQ02127 395 aa16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 FUT7Q11130 342 aa16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 ALG10Q5BKT4 473 aa16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 TCTE1Q5JU00 501 aa16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM31Q5JXX7 168 aa16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 LIPNQ5VXI9 398 aa16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 C10orf53Q8N6V4 93 aa16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 LRRC75AQ8NAA5 344 aa16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 LRRC20Q8TCA0 184 aa16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 TAS2R5Q9NYW4 299 aa16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 B8ZZF3 427 aa16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF432O94892 652 aa16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 TXNDC12O95881 172 aa16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 IFNGR1P15260 489 aa16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 RAD52P43351 418 aa16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 MECP2P51608 486 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 HHEXQ03014 270 aa16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 C7orf61Q8IZ16 206 aa16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 AVL9Q8NBF6 648 aa16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 OIT3Q8WWZ8 545 aa16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 SEC22CQ9BRL7 303 aa16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM106CQ9BVX2 250 aa16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 GPR174Q9BXC1 333 aa16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 MMP25Q9NPA2 562 aa16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 FRRS1LQ9P0K9 344 aa16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 CLDN16Q9Y5I7 305 aa16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 C4orf47A7E2U8 309 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 SNRPGP15A8MWD9 76 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 I3L521 148 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 SNAPC5O75971 98 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 NDUFB6O95139 128 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 IL5P05113 134 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 ADRA2CP18825 462 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 TFF2Q03403 129 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 LINC00303Q3SY05 128 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 EMC4Q5J8M3 183 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 STPG1Q5TH74 334 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 LRRTM1Q86UE6 522 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 CDC20BQ86Y33 519 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 MEIOBQ8N635 442 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 OR2T4Q8NH00 348 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 MOGAT1Q96PD6 335 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 TSSK2Q96PF2 358 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 MNTQ99583 582 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 NARFLQ9H6Q4 476 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF69Q9UC07 566 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 A0A087WV48 116 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 TUBAL3A6NHL2 446 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF254O75437 659 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 UBL4AP11441 157 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 DCTDP32321 178 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 ADH7P40394 386 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 CTXN1P60606 82 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 RAP2BP61225 183 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 RPS15P62841 145 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 FNDC7Q5VTL7 733 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF626Q68DY1 528 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 DNM1P46Q6ZS02 220 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 TAF8Q7Z7C8 310 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 TMPRSS12Q86WS5 348 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF615Q8N8J6 731 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 THEM6Q8WUY1 208 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC74AQ96AQ1 378 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 CHIAQ9BZP6 476 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 PRODH2Q9UF12 536 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 MPDZO75970 2070 aa16.59■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 F5P12259 2224 aa16.59■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 ANXA2P2A6NMY6 339 aa16.59■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 RRASP10301 218 aa16.59■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 MAOAP21397 527 aa16.59■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 ENPP1P22413 925 aa16.59■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 SOX2P48431 317 aa16.59■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 CCR4P51679 360 aa16.59■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 BTG2P78543 158 aa16.59■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 SKP2Q13309 424 aa16.59■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF227Q86WZ6 799 aa16.59■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 COMMD4Q9H0A8 199 aa16.59■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 PIPOXQ9P0Z9 390 aa16.59■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 GRHPRQ9UBQ7 328 aa16.59■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 LAMP5Q9UJQ1 280 aa16.59■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms