RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000315965.6

CCDC71L-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71 like, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CCDC71L, Length 1,575 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71L-201ENST00000315965 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 ITPR1Q14643 2758 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 ZNF3P17036 446 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 GABRB1P18505 474 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 PON3Q15166 354 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 SLC35D2Q76EJ3 337 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 OR4K13Q8NH42 304 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 TMEM163Q8TC26 289 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 RASD2Q96D21 266 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 TUBA1CQ9BQE3 449 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 CYTIPO60759 359 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 SLC2A10O95528 541 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 BCL10O95999 233 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 IFNGR1P15260 489 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 CDK5R2Q13319 367 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 SLC17A1Q14916 467 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 FAM26EQ8N5C1 309 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 OR9K2Q8NGE7 335 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 OR52E2Q8NGJ4 325 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 ZPLD1Q8TCW7 415 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 SLX1AQ9BQ83 275 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 PRRG4Q9BZD6 226 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 FN3KQ9H479 309 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 PNPLA3Q9NST1 481 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 GPR52Q9Y2T5 361 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 GTF3C1Q12789 2109 aa21.43■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 XKRYO14609 159 aa21.43■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 PTGS2P35354 604 aa21.43■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 TDGF1P3P51864 188 aa21.43■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 TEKQ02763 1124 aa21.43■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 FAM205BPQ63HN1 556 aa21.43■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 PCSK4Q6UW60 755 aa21.43■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 NHLRC1Q6VVB1 395 aa21.43■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 JAZF1Q86VZ6 243 aa21.43■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 CNIH3Q8TBE1 160 aa21.43■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 SPTA1P02549 2419 aa21.43■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 USP24Q9UPU5 2620 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 A6NIZ1 184 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 CLCA1A8K7I4 914 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 ACVR1BP36896 505 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 RAP1BP61224 184 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 RAP1AP62834 184 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 MELKQ14680 651 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 SLC25A30Q5SVS4 291 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 ARMC4Q5T2S8 1044 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 HDDC2Q7Z4H3 204 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 FGD2Q7Z6J4 655 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 ADCK1Q86TW2 530 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 ZNF519Q8TB69 540 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 FNDC9Q8TBE3 224 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 RNF128Q8TEB7 428 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 APH1BQ8WW43 257 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 ASB10Q8WXI3 467 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 Q96MT0 163 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 ASF1BQ9NVP2 202 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 CLN6Q9NWW5 311 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 MED29Q9NX70 200 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 AASSQ9UDR5 926 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 ZNF175Q9Y473 711 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 TTLL8A6PVC2 850 aa21.41■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 AHRRA9YTQ3 701 aa21.41■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 ZNHIT1O43257 154 aa21.41■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 PAICSP22234 425 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 ACVR2AP27037 513 aa21.41■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 SLC16A1P53985 500 aa21.41■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 CRMP1Q14194 572 aa21.41■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 MESTQ5EB52 335 aa21.41■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa21.41■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 MEDAGQ5VYS4 303 aa21.41■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 CREB3L2Q70SY1 520 aa21.41■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 SLC37A3Q8NCC5 494 aa21.41■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 SDR9C7Q8NEX9 313 aa21.41■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 OR5M9Q8NGP3 310 aa21.41■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 TXNDC15Q96J42 360 aa21.41■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 LRR1Q96L50 414 aa21.41■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 KLHL9Q9P2J3 617 aa21.41■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 ALPK2Q86TB3 2170 aa21.41■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 ZNF716A6NP11 495 aa21.4■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 ARHGEF9O43307 516 aa21.4■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 WBP4O75554 376 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 ITGADQ13349 1161 aa21.4■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 OCLNQ16625 522 aa21.4■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 C6orf141Q5SZD1 244 aa21.4■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa21.4■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa21.4■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa21.4■■□□□ 1.02
CCDC71L-201ENST00000315965 NPEPL1Q8NDH3 523 aa21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms