RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CD99L2Q8TCZ2 262 aa20.75■□□□□ 0.91
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CASRP41180 1078 aa20.75■□□□□ 0.91
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OR4K13Q8NH42 304 aa20.74■□□□□ 0.91
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CD3DP04234 171 aa20.74■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PTAFRP25105 342 aa20.74■□□□□ 0.91
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMEM25Q86YD3 366 aa20.74■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 STOML3Q8TAV4 291 aa20.74■□□□□ 0.91
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UQCC1Q9NVA1 299 aa20.74■□□□□ 0.91
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OR7G2Q8NG99 324 aa20.72■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NUS1Q96E22 293 aa20.72■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CTAG2O75638 210 aa20.72■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP20.72■□□□□ 0.914e-6■□□□□ 10.2
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NKAIN2Q5VXU1 208 aa20.72■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C17orf99Q6UX52 265 aa20.72■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF619Q8N2I2 560 aa20.72■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OR4K14Q8NGD5 310 aa20.72■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HSPA12BQ96MM6 686 aa20.72■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 STEAP1Q9UHE8 339 aa20.72■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa20.71■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CXCL14O95715 111 aa20.71■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PRF1P14222 555 aa20.71■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NID1P14543 1247 aa20.71■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CERS1P27544 350 aa20.71■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BCL6P41182 706 aa20.71■□□□□ 0.91
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