RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
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GGPS1-201ENST00000282841 TMBIM6P55061 237 aa9.91□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 CD83Q01151 205 aa9.91□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 SSPNQ14714 243 aa9.91□□□□□ -0.82
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GGPS1-201ENST00000282841 KRT77Q7Z794 578 aa9.91□□□□□ -0.82
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GGPS1-201ENST00000282841 NPEPL1Q8NDH3 523 aa9.91□□□□□ -0.82
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GGPS1-201ENST00000282841 PFDN2Q9UHV9 154 aa9.91□□□□□ -0.82
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GGPS1-201ENST00000282841 E9PI62 339 aa9.9□□□□□ -0.82
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GGPS1-201ENST00000282841 RAB40BQ12829 278 aa9.9□□□□□ -0.82
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GGPS1-201ENST00000282841 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
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GGPS1-201ENST00000282841 ERVK13-1Q9NX77 482 aa9.89□□□□□ -0.83
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GGPS1-201ENST00000282841 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
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GGPS1-201ENST00000282841 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 PINLYPA6NC86 204 aa9.89□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 M0R3G1 203 aa9.89□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 CCRL2O00421 344 aa9.89□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 GABARAPO95166 117 aa9.89□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 AHSA1O95433 338 aa9.89□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 SPINK2P20155 84 aa9.89□□□□□ -0.83
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