RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 SLAMF7Q9NQ25 335 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ACOXLQ9NUZ1 547 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 MED29Q9NX70 200 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 B4GALT7Q9UBV7 327 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SRPK3Q9UPE1 567 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ZNF281Q9Y2X9 895 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 TMED7Q9Y3B3 224 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 MAST2Q6P0Q8 1798 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 MEGF11A6BM72 1044 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 M0R082 166 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 FABP7O15540 132 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 FBXO24O75426 580 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 APOC1P02654 83 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 PTHLHP12272 177 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 TCN2P20062 427 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 PRKAR1BP31321 381 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 HOXD12P35452 270 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 FOLR3P41439 243 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 WNT3P56703 355 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 TBC1D25Q3MII6 688 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SLC36A2Q495M3 483 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 C3orf38Q5JPI3 329 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 GLYATL3Q5SZD4 288 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SAXO2Q658L1 398 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 COMTD1Q86VU5 262 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SIAH3Q8IW03 269 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 AGBL5Q8NDL9 886 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 GIMAP1Q8WWP7 306 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 EDAQ92838 391 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 FGGYQ96C11 551 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ACTR6Q9GZN1 396 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 CHRDQ9H2X0 955 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 DOCK10Q96BY6 2186 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 IDSB3KWA1 339 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SYT5O00445 386 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 BRINP1O60477 761 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 CTSVO60911 334 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 KCNK2O95069 426 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 OR2T7P0C7T2 308 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ZNF44P15621 663 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 CFL1P23528 166 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 FPR3P25089 353 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 HTR1FP30939 366 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 UGT2B10P36537 528 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 TFF2Q03403 129 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 GPR157Q5UAW9 335 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 VHLLQ6RSH7 139 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 Q6ZNX1 250 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 OR2T27Q8NH04 317 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 STOML3Q8TAV4 291 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 STT3BQ8TCJ2 826 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 THRSPQ92748 146 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 NINJ1Q92982 152 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 RSPRY1Q96DX4 576 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 BMFQ96LC9 184 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SEC22CQ9BRL7 303 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SLC38A1Q9H2H9 487 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 WDR76Q9H967 626 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ASIC5Q9NY37 505 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 MUTYHQ9UIF7 546 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 MMP17Q9ULZ9 603 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 TLCD2A6NGC4 264 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ZAR1LA6NP61 321 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SHISA8B8ZZ34 492 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SC5DO75845 299 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 PRR35P0CG20 571 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 DPP4P27487 766 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 RACK1P63244 317 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 FABP5Q01469 135 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 FAM189A2Q15884 450 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 TMEM244Q5VVB8 128 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 NIPAL3Q6P499 406 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 GSG1LQ6UXU4 331 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ZNF620Q6ZNG0 422 aa5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms