RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 NUMBLQ9Y6R0 609 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ZBTB42B2RXF5 422 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SLC16A6O15403 523 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ALOX12BO75342 701 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 GASTP01350 101 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CD53P19397 219 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 PSMB5P28074 263 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 C14orf28Q4W4Y0 310 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 FAM71E1Q6IPT2 247 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 APOOLQ6UXV4 268 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 GRINAQ7Z429 371 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 NAXDQ8IW45 347 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 PELI3Q8N2H9 469 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 DMBX1Q8NFW5 382 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 OR1S2Q8NGQ3 325 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 DNAJA3Q96EY1 480 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SCPEP1Q9HB40 452 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ARRDC5A6NEK1 342 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 J3QR89 54 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SPINT2O43291 252 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 DFFBO76075 338 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CBX7O95931 251 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 P2RX1P51575 399 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 MTCP1P56278 107 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 DPTQ07507 201 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 IKZF1Q13422 519 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 C2orf76Q3KRA6 126 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SLC22A6Q4U2R8 563 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ELP2Q6IA86 826 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SLC22A25Q6T423 547 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 GDF7Q7Z4P5 450 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 KIAA1958Q8N8K9 716 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 NRG4Q8WWG1 115 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CORO2AQ92828 525 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 LURAP1Q96LR2 239 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 C3orf30Q96M34 536 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 OR6C1Q96RD1 312 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SERTAD4Q9NUC0 356 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 MARCH5Q9NX47 278 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 PISDQ9UG56 409 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 USP54Q70EL1 1684 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 MEIS3P2A8K0S8 358 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ZNF254O75437 659 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 BMP1P13497 986 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 GIFP27352 417 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 DAPP51397 102 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 MFAP5Q13361 173 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 GALEQ14376 348 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 RNLSQ5VYX0 342 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SFXN4Q6P4A7 337 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 MORN4Q8NDC4 146 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 LFNGQ8NES3 379 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 OR51L1Q8NGJ5 315 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SLC38A5Q8WUX1 472 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SLC29A1Q99808 456 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 HAO2Q9NYQ3 351 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 PMS2P1A4D2B8 440 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CSO75390 466 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TRAPPC2P0DI81 140 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TRAPPC2BP0DI82 140 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 AADACP22760 399 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TNFSF8P32971 234 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ARR3P36575 388 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 OR1D4P47884 311 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 GIPRP48546 466 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 RAC1P63000 192 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 FOXK2Q01167 660 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CDKN3Q16667 212 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 MFSD12Q6NUT3 480 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 HIST2H3AQ71DI3 136 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 DPPA2Q7Z7J5 298 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 KMT5CQ86Y97 462 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 PGBD5Q8N414 524 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 RHOXF1Q8NHV9 184 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 KRBOX1C9JBD0 128 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 VAMP5O95183 116 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SOD1P00441 154 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 DPP4P27487 766 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ZNF77Q15935 545 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 FCRL6Q6DN72 434 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 LYPD4Q6UWN0 246 aa6.67□□□□□ -1.34
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