RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637624.1

PXN-222, Transcript of paxillin, human

TSL 2

Gene PXN, Length 4,132 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PXN-222	ENST00000637624	MARCH5	Q9NX47	278 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	URAD	A6NGE7	173 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	OR8U9	P0C7N5	309 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	MAK	P20794	623 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	PTAFR	P25105	342 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	CD70	P32970	193 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	VIPR2	P41587	438 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	RAG2	P55895	527 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	SHH	Q15465	462 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	KDM8	Q8N371	416 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	GATS	Q8NAP1	163 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	AVL9	Q8NBF6	648 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	C1orf226	A1L170	272 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	KNG1	P01042	644 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	KLKB1	P03952	638 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	ASGR2	P07307	311 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	CA3	P07451	260 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	HOXB5	P09067	269 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	CLU	P10909	449 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	CD22	P20273	847 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	GLP1R	P43220	463 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	HAAO	P46952	286 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	GIMAP5	Q96F15	307 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	DHDH	Q9UQ10	334 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	RP1	P56715	2156 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	IFNA10	P01566	189 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	FPR3	P25089	353 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	TMEM218	A2RU14	115 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	SLC31A1	O15431	190 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	OR2F2	O95006	317 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	SOD2	P04179	222 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	CD3D	P04234	171 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	ZNF823	P16415	610 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	PSMB5	P28074	263 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	GABRA3	P34903	492 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	RFC3	P40938	356 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	OR2F1	Q13607	317 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	GUCA2B	Q16661	112 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	PXK	Q7Z7A4	578 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	FRMD1	Q8N878	549 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	TEX19	Q8NA77	164 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	GPR148	Q8TDV2	347 aa		11.21	□□□□□ -0.61

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