RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629179.1

PNKP-223, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 4

Gene PNKP, Length 811 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-223	ENST00000629179	UEVLD	Q8IX04	471 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF611	Q8N823	705 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PNKP-223	ENST00000629179	SCAI	Q8N9R8	606 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PNKP-223	ENST00000629179	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PNKP-223	ENST00000629179	MPP4	Q96JB8	637 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PNKP-223	ENST00000629179	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
PNKP-223	ENST00000629179	PIP5K1A	Q99755	562 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PNKP-223	ENST00000629179	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PNKP-223	ENST00000629179	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
PNKP-223	ENST00000629179	RCE1	Q9Y256	329 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PNKP-223	ENST00000629179	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	CXCR6	O00574	342 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	PLPP3	O14495	311 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	ABCD4	O14678	606 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	GSTA4	O15217	222 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	SLC43A1	O75387	559 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	MT-ATP6	P00846	226 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	AHCY	P23526	432 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	GSK3B	P49841	420 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	TAS2R41	P59536	307 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	PSME3	P61289	254 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	SELENOW	P63302	87 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	PUDP	Q08623	228 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF74	Q16587	644 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	OR5J2	Q8NH18	312 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	TXNDC15	Q96J42	360 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	OR2M2	Q96R28	347 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	EMC6	Q9BV81	110 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	SHISA9	B4DS77	424 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	C11orf98	E9PRG8	122 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179		M0R1B8	84 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	SERPINI2	O75830	405 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	ADORA3	P0DMS8	318 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	CD99	P14209	185 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	PRDX6	P30041	224 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	HOXC12	P31275	282 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	PRPS1	P60891	318 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	CARD17	Q5XLA6	110 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	TMEM123	Q8N131	208 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	FBXW5	Q969U6	566 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	ALG2	Q9H553	416 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	GPR35	Q9HC97	309 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	NANS	Q9NR45	359 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	MED29	Q9NX70	200 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179		A0A096LPE4	126 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179		A0A1W2PPZ6	126 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	SLC35F4	A4IF30	521 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	DYNC1I1	O14576	645 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	OR5F1	O95221	314 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF682	O95780	498 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	NCK1	P16333	377 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	PTAFR	P25105	342 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	CD40	P25942	277 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	UGT2B15	P54855	530 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	SPOCK1	Q08629	439 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	PXK	Q7Z7A4	578 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
PNKP-223	ENST00000629179	PFN4	Q8NHR9	129 aa		12.43	□□□□□ -0.42

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