RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 IGHMP01871 453 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 PAICSP22234 425 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 ACVR2AP27037 513 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 HTR1FP30939 366 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 GFRA1P56159 465 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 PLGLB1Q02325 96 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 NADK2Q4G0N4 442 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 OTULINQ96BN8 352 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 FREM3P0C091 2139 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 LINC01387J3KSC0 135 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 SULT2B1O00204 365 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC2A5P22732 501 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 MAGEA5P43359 124 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 MTNR1AP48039 350 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 P2RY4P51582 365 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC35A1P78382 337 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM99Q8N816 258 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 RNFT2Q96EX2 444 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 KLHL15Q96M94 604 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 NMNAT3Q96T66 252 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 TXNIPQ9H3M7 391 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 QPCTLQ9NXS2 382 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 PIEZO1Q92508 2521 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PNV4 684 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM166BA8MTA8 275 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 M0R3G1 203 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 ADRA2AP08913 450 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 ID4P47928 161 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 RPL27P61353 136 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 ACKR1Q16570 336 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 KLHL22Q53GT1 634 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 MESTQ5EB52 335 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 SATL1Q86VE3 508 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 KDM8Q8N371 416 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 SVOPQ8N4V2 548 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 SMPDL3BQ92485 455 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 LGALS12Q96DT0 336 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 VCX3AQ9NNX9 186 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A0J9YW62 118 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 OR6C68A6NDL8 312 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 PLGP00747 810 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 CELA3AP09093 270 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB40BQ12829 278 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 TMED1Q13445 227 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 NEDD8Q15843 81 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 GGNQ86UU5 652 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF519Q8TB69 540 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM80Q96HE8 168 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 CDCA4Q9BXL8 241 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PRG6 482 aa22.31■■□□□ 1.16
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CAPNS1-215ENST00000628018 NPIPB13A6NJU9 1138 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 NPIPB4C9JG80 1138 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 RRP8O43159 456 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 ADRB1P08588 477 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 CLUP10909 449 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 HLA-DOBP13765 273 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 MAP2K4P45985 399 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 CD97P48960 835 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 CLDN20P56880 219 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 PPIAP62937 165 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 H3F3AP84243 136 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 IRF3Q14653 427 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 LEG1Q6P5S2 330 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 PAQR6Q6TCH4 344 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 IGFL3Q6UXB1 125 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 PXKQ7Z7A4 578 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC22A16Q86VW1 577 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 JAZF1Q86VZ6 243 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 OR52I1Q8NGK6 324 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 ZPLD1Q8TCW7 415 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 FAR1Q8WVX9 515 aa22.31■■□□□ 1.16
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CAPNS1-215ENST00000628018 TEAD3Q99594 435 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 MFRPQ9BY79 579 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 OR51V1Q9H2C8 321 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 ACOT13Q9NPJ3 140 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 B3GAT1Q9P2W7 334 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 MED12Q93074 2177 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 TRAV17A0A0B4J275 112 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC182A6NF36 153 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC22A31A6NKX4 558 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 AQP7P3A6NL99 342 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 SERPINI2O75830 405 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 FADS2O95864 444 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 KLHL12Q53G59 568 aa22.3■■□□□ 1.16
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