RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627212.2

RAPGEF6-215, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAPGEF6, Length 4,694 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-215ENST00000627212 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa9.22□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 A0A1W2PS29 197 aa9.22□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 H0Y8X5 98 aa9.22□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 CR2P20023 1033 aa9.22□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 HTR2CP28335 458 aa9.22□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 CD79BP40259 229 aa9.22□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 SLC6A8P48029 635 aa9.22□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 MTNR1BP49286 362 aa9.22□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 UBE2NLQ5JXB2 153 aa9.22□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 MFSD12Q6NUT3 480 aa9.22□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 Q6ZTK2 550 aa9.22□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 CMTM1Q8IZ96 169 aa9.22□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 OR52I2Q8NH67 350 aa9.22□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa9.22□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 CD6P30203 668 aa9.22□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 DAP3P51398 398 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 MEF2DQ14814 521 aa9.22□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 SLC48A1Q6P1K1 146 aa9.22□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 MED25Q71SY5 747 aa9.22□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 LINC01465Q8N7H1 131 aa9.22□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 SLC25A46Q96AG3 418 aa9.22□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 PSD2Q9BQI7 771 aa9.22□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 LMAN1LQ9HAT1 526 aa9.22□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 ACOXLQ9NUZ1 547 aa9.22□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa9.22□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 PCM1Q15154 2024 aa9.21□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 ATG2BQ96BY7 2078 aa9.21□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 B8ZZF3 427 aa9.21□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 LILRB3O75022 631 aa9.21□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 TIMP1P01033 207 aa9.21□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 SPNP16150 400 aa9.21□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 SELENOVP59797 346 aa9.21□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 LIPNQ5VXI9 398 aa9.21□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 LIX1LQ8IVB5 337 aa9.21□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 SLC41A2Q96JW4 573 aa9.21□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 C20orf85Q9H1P6 137 aa9.21□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 PLAC1Q9HBJ0 212 aa9.21□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 SPHK1Q9NYA1 384 aa9.21□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 LRIT1Q9P2V4 623 aa9.21□□□□□ -0.93
RAPGEF6-215ENST00000627212 A0A1W2PR48 441 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 SERINC4A6NH21 518 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 NXPH3O95157 252 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 SBK2P0C263 348 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 PPP3CBP16298 524 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 S100A11P31949 105 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 CLINT1Q14677 625 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 LTC4SQ16873 150 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 PYCR3Q53H96 274 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 SAXO2Q658L1 398 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 PTOV1Q86YD1 416 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 SUMF2Q8NBJ7 301 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 SUMF1Q8NBK3 374 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 NXPE3Q969Y0 559 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 PDXPQ96GD0 296 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 SPACA5Q96QH8 159 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 TIMM29Q9BSF4 260 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 MRI1Q9BV20 369 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 VN1R3Q9BXE9 311 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 SEMA4CQ9C0C4 833 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 B3GNT2Q9NY97 397 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 CACNA1SQ13698 1873 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 A6NIZ1 184 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 HMGN4O00479 90 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 NSA2O95478 260 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 SRMP19623 302 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 FPR3P25089 353 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 NPY4RP50391 375 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 TAS2R31P59538 309 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 RAP1BP61224 184 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 RAP1AP62834 184 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 FABP5Q01469 135 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 YIF1BQ5BJH7 314 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 GPR139Q6DWJ6 353 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 LACC1Q8IV20 430 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 RIMKLAQ8IXN7 391 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 SVBPQ8N300 66 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 FRMD1Q8N878 549 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 FGGYQ96C11 551 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 MYADMQ96S97 322 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 MAP3K3Q99759 626 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 EMC6Q9BV81 110 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 PTDSS2Q9BVG9 487 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 TMEM59Q9BXS4 323 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 GSX2Q9BZM3 304 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 NIPAL2Q9H841 368 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 PLEKHA3Q9HB20 300 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 FGF22Q9HCT0 170 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 KCNIP1Q9NZI2 227 aa9.21□□□□□ -0.94
RAPGEF6-215ENST00000627212 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms