RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	DAPP1	Q9UN19	280 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	LRP4	O75096	1905 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	SERPINA1	P01009	418 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	UMOD	P07911	640 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	NR2F6	P10588	404 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	SSTR4	P31391	388 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	AHR	P35869	848 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	RBP2	P50120	134 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	NUDT6	P53370	316 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	SERTAD2	Q14140	314 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	GUCA2B	Q16661	112 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	ACER2	Q5QJU3	275 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	6.62	□□□□□ -1.35	4e-6	■■■□□ 17.7
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	ASPN	Q9BXN1	380 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	GPR83	Q9NYM4	423 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	AHSP	Q9NZD4	102 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	GHRL	Q9UBU3	117 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495		V9GYQ6	96 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	C17orf105	B2RV13	164 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	RGS14	O43566	566 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	STS	P08842	583 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	UROS	P10746	265 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	G6PD	P11413	515 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	SMCO1	Q147U7	214 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	DDI2	Q5TDH0	399 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	CA13	Q8N1Q1	262 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	PRR18	Q8N4B5	295 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	SCMH1	Q96GD3	660 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC115	Q96NT0	180 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	PITX2	Q99697	317 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	MARCH11	A6NNE9	402 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495		H0YIV9	168 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	IFNA2	P01563	188 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	COX7A2	P14406	83 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	LCN1	P31025	176 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	CSRP3	P50461	194 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	DHODH	Q02127	395 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	EMX2	Q04743	252 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495		Q6ZSR9	355 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC34A3	Q8N130	599 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	SVBP	Q8N300	66 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM156	Q8N614	296 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	TEX19	Q8NA77	164 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	OR6X1	Q8NH79	312 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	DGAT2	Q96PD7	388 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNJ15	Q99712	375 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	GPR160	Q9UJ42	338 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		6.61	□□□□□ -1.35

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