RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 SPAG4Q9NPE6 437 aa21.88■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 LRRN3E7EW58 273 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 THRBP10828 461 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 TAS2R41P59536 307 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 PUDPQ08623 228 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 PMS2P3Q13401 168 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 ZNF74Q16587 644 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 C10orf53Q8N6V4 93 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 SLC25A15Q9Y619 301 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 ZNF587BE7ETH6 402 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 GSTA4O15217 222 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 HPRP00739 348 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 PLAUP00749 431 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 RBM34P42696 430 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 DEFB113Q30KQ7 82 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 ADAM5Q6NVV9 412 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 NHLRC1Q6VVB1 395 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 UEVLDQ8IX04 471 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 OR5J2Q8NH18 312 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 FKRPQ9H9S5 495 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 RIMS3Q9UJD0 308 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 RNF115Q9Y4L5 304 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 NOX1Q9Y5S8 564 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 USF3Q68DE3 2245 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 PLPP3O14495 311 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 KRT33AO76009 404 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 CD3EP07766 207 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 C9orf135Q5VTT2 229 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 CBLL1Q75N03 491 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 PXKQ7Z7A4 578 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 ANKK1Q8NFD2 765 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 OR52N5Q8NH56 324 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 NPAP1Q9NZP6 1156 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 DPRXA6NFQ7 191 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 UPK3AO75631 287 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 CH25HO95992 272 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 IGF2P01344 180 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 HLA-DOBP13765 273 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 IL1RL1Q01638 556 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 BSPH1Q075Z2 132 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 LGALS3BPQ08380 585 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 VTCN1Q7Z7D3 282 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 NKAIN4Q8IVV8 208 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 WDR31Q8NA23 367 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 PIGTQ969N2 578 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 OR2M2Q96R28 347 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 PIP5K1AQ99755 562 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 NANSQ9NR45 359 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 SLC17A5Q9NRA2 495 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 TAGLN3Q9UI15 199 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 ZNF229Q9UJW7 825 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 AMDHD2Q9Y303 409 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa21.83■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 SLC43A1O75387 559 aa21.83■■□□□ 1.09
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PMS1-220ENST00000618056 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 LINGO2Q7L985 606 aa21.83■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 TMEM123Q8N131 208 aa21.83■■□□□ 1.09
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PMS1-220ENST00000618056 PRRC1Q96M27 445 aa21.83■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 A4GNTQ9UNA3 340 aa21.83■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
PMS1-220ENST00000618056 ACANP16112 2415 aa21.83■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 HS3ST1O14792 307 aa21.83■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 ASAH2BP0C7U1 165 aa21.83■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 ZP4Q12836 540 aa21.83■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 CCDC121Q6ZUS5 278 aa21.83■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 ZNF611Q8N823 705 aa21.83■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 PIK3C3Q8NEB9 887 aa21.83■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 TMEM255BQ8WV15 326 aa21.83■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 HS6ST2Q96MM7 605 aa21.83■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 ARL8BQ9NVJ2 186 aa21.83■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 ZNF682O95780 498 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 SERPINA1P01009 418 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 IFNW1P05000 195 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 ADORA3P0DMS8 318 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 HOXC12P31275 282 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 ST3GAL3Q11203 375 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 IFI44LQ53G44 452 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 PGAM4Q8N0Y7 254 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 OR1K1Q8NGR3 316 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 TMEM239Q8WW34 195 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 CCL19Q99731 98 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 OBP2BQ9NPH6 170 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 ADA2Q9NZK5 511 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 A0A1W2PR80 420 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 CLOCKO15516 846 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 AHCYP23526 432 aa21.81■■□□□ 1.08
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