RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606190.1

RNU2-4P-201, Transcript of RNA, U2 small nuclear 4, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU2-4P, Length 192 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU2-4P-201ENST00000606190 RNF222A6NCQ9 220 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 ZNF716A6NP11 495 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 WASH3PC4AMC7 463 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 TAPBPO15533 448 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 DUX1O43812 170 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 SH3BP5O60239 455 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 GABARAPO95166 117 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 STAMBPO95630 424 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 LGALS2P05162 132 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 BCHEP06276 602 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 CSNK1A1P48729 337 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 CHI3L2Q15782 390 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 BCL7AQ4VC05 210 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 SMUG1Q53HV7 270 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 ADNP2Q6IQ32 1131 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 ACSM5Q6NUN0 579 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 PRMT9Q6P2P2 845 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 AFTPHQ6ULP2 937 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 WASH2PQ6VEQ5 465 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 ZNF410Q86VK4 478 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 SERPINA12Q8IW75 414 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 CCDC89Q8N998 374 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 LPCAT1Q8NF37 534 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 ABHD3Q8WU67 409 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 AKR1E2Q96JD6 320 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 SLC35A5Q9BS91 424 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 TAS2R1Q9NYW7 299 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 AIPL1Q9NZN9 384 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 ENOPH1Q9UHY7 261 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 PRR14LQ5THK1 2151 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 ZBED9Q6R2W3 1325 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 USP24Q9UPU5 2620 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 A0A1B0GVI7 797 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 F10P00742 488 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 ASGR1P07306 291 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 DAP3P51398 398 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 CDH4P55283 916 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 HSD17B7P56937 341 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 MICBQ29980 383 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 STPG2Q8N412 459 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 DEFB119Q8N690 84 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 KIR3DL3Q8N743 410 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 NOXO1Q8NFA2 376 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 VN1R2Q8NFZ6 395 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 OR4K14Q8NGD5 310 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 OR51G2Q8NGK0 314 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 FIBINQ8TAL6 211 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 C15orf40Q8WUR7 153 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 HTR3CQ8WXA8 447 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 HPDLQ96IR7 371 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 TBL1YQ9BQ87 522 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 CENPOQ9BU64 300 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP-0.05□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 SLC2A8Q9NY64 477 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 KCNIP1Q9NZI2 227 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 XCL2Q9UBD3 114 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 FANCIQ9NVI1 1328 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 RASGRF2O14827 1237 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 OPN1LWP04000 364 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 ZNF806P0C7X5 589 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 GPM6AP51674 278 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 IL1RL1Q01638 556 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 NUCB1Q02818 461 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 SNX1Q13596 522 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 SS18Q15532 418 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 TRIM16LQ309B1 348 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 C12orf60Q5U649 245 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 ZFAND6Q6FIF0 208 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 ABHD13Q7L211 337 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 TMEM17Q86X19 198 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 OR8H2Q8N162 312 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 MREGQ8N565 214 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 LRRC75AQ8NAA5 344 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 OR4K5Q8NGD3 323 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 ZNF502Q8TBZ5 544 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 FGF11Q92914 225 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 SIRPDQ9H106 197 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 RHBGQ9H310 441 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU2-4P-201ENST00000606190 WDR76Q9H967 626 aa-0.06□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms