RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SOX2P48431 317 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCR6P51684 374 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF117Q03924 483 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NSDHLQ15738 373 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PYHIN1Q6K0P9 492 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SIAH3Q8IW03 269 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR6V1Q8N148 313 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LRRC75AQ8NAA5 344 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR1L3Q8NH93 324 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF721Q8TF20 911 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 YIPF5Q969M3 257 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADIPOR1Q96A54 375 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AUNIPQ9H7T9 357 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HIF3AQ9Y2N7 669 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BLACEA4D250 179 aa10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FITM1A5D6W6 292 aa10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LMO7DNF2Z398 122 aa10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 H3BMH7 237 aa10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGKV3-11P04433 115 aa10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANKRD34CP0C6C1 535 aa10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ASAH2BP0C7U1 165 aa10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PTHLHP12272 177 aa10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GIFP27352 417 aa10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARL4DP49703 201 aa10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZSWIM7Q19AV6 140 aa10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C14orf28Q4W4Y0 310 aa10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF687Q8N1G0 1237 aa10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC43A2Q8N370 569 aa10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZDHHC12Q96GR4 267 aa10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SYT4Q9H2B2 425 aa10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WDR76Q9H967 626 aa10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GRHPRQ9UBQ7 328 aa10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FREM2Q5SZK8 3169 aa10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FREM3P0C091 2139 aa10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MBTPS2O43462 519 aa10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AKR7A2O43488 359 aa10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLGP00747 810 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SYPP08247 313 aa10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PNMTP11086 282 aa10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MESTQ5EB52 335 aa10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LIPNQ5VXI9 398 aa10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DPY19L4Q7Z388 723 aa10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLITRK4Q8IW52 837 aa10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C9orf40Q8IXQ3 194 aa10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CMTM4Q8IZR5 234 aa10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TOMM5Q8N4H5 51 aa10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC25A36Q96CQ1 311 aa10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC46A1Q96NT5 459 aa10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TSPAN32Q96QS1 320 aa10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC19A3Q9BZV2 496 aa10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BEX1Q9HBH7 125 aa10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa10.71□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SDHAP31040 664 aa10.71□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAPQ12884 760 aa10.71□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TDGQ13569 410 aa10.71□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM205BPQ63HN1 556 aa10.71□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR5M10Q6IEU7 315 aa10.71□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa10.71□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF440Q8IYI8 595 aa10.71□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TDHQ8IZJ6 230 aa10.71□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DNAAF1Q8NEP3 725 aa10.71□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR7G1Q8NGA0 311 aa10.71□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CREB3L1Q96BA8 519 aa10.71□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LRFN5Q96NI6 719 aa10.71□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF879B4DU55 563 aa10.71□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARHGEF9O43307 516 aa10.71□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MT-ND4P03905 459 aa10.71□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP10.71□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COL19A1Q14993 1142 aa10.71□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC35D3Q5M8T2 416 aa10.71□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF684Q5T5D7 378 aa10.71□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LANCL3Q6ZV70 420 aa10.71□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EXD3Q8N9H8 876 aa10.71□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BEST4Q8NFU0 473 aa10.71□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR6N2Q8NGY6 317 aa10.71□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR10AC1Q8NH08 325 aa10.71□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FRRS1LQ9P0K9 344 aa10.71□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TEKT2Q9UIF3 430 aa10.71□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IKZF2Q9UKS7 526 aa10.71□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MKL2Q9ULH7 1088 aa10.71□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF281Q9Y2X9 895 aa10.71□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CACNA1EQ15878 2313 aa10.71□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa10.71□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AKR7A3O95154 331 aa10.71□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UBL3O95164 117 aa10.71□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UQCRC1P31930 480 aa10.71□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NUDT1P36639 197 aa10.71□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADH7P40394 386 aa10.71□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FCN2Q15485 313 aa10.71□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.9 ms