RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598256.1

LTBP4-222, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 2

Gene LTBP4, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-222	ENST00000598256	KDM8	Q8N371	416 aa		14.21	□□□□□ -0.13
LTBP4-222	ENST00000598256	PARP8	Q8N3A8	854 aa		14.21	□□□□□ -0.13
LTBP4-222	ENST00000598256	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		14.21	□□□□□ -0.13
LTBP4-222	ENST00000598256	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		14.21	□□□□□ -0.13
LTBP4-222	ENST00000598256	RNF128	Q8TEB7	428 aa		14.21	□□□□□ -0.13
LTBP4-222	ENST00000598256	ABHD3	Q8WU67	409 aa		14.21	□□□□□ -0.13
LTBP4-222	ENST00000598256	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		14.21	□□□□□ -0.13
LTBP4-222	ENST00000598256	CYTIP	O60759	359 aa		14.2	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	AQP8	O94778	261 aa		14.2	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	VAMP5	O95183	116 aa		14.2	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	F13B	P05160	661 aa		14.2	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	14.2	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	POU1F1	P28069	291 aa		14.2	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	P2RY4	P51582	365 aa		14.2	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	FXYD6P3	P58550	94 aa		14.2	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	14.2	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		14.2	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	14.2	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		14.2	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	RPTN	Q6XPR3	784 aa		14.2	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		14.2	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	14.2	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		14.2	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	UEVLD	Q8IX04	471 aa		14.2	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		14.2	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	SAMD8	Q96LT4	415 aa		14.2	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	OXGR1	Q96P68	337 aa		14.2	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		14.2	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		14.2	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		14.2	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	INIP	Q9NRY2	104 aa		14.2	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	14.2	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		14.2	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		14.2	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		14.2	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	TINAG	Q9UJW2	476 aa		14.2	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	NOTCH2	Q04721	2471 aa		14.2	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	CD8B2	A6NJW9	211 aa		14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	MS4A18	H0YCH9	400 aa		14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	PTP4A3	O75365	173 aa		14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	TGM6	O95932	706 aa		14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	TSPAN19	P0C672	248 aa		14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF43	P17038	809 aa		14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	VHL	P40337	213 aa		14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	CTXN1	P60606	82 aa		14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	ESRRG	P62508	458 aa		14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	ZP4	Q12836	540 aa		14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	FHL1	Q13642	323 aa		14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	POU4F3	Q15319	338 aa		14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	WNT2B	Q93097	391 aa		14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	IFT27	Q9BW83	186 aa		14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	CALHM2	Q9HA72	323 aa		14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	IL20	Q9NYY1	176 aa		14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	EMC3	Q9P0I2	261 aa		14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		14.19	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	14.18	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256		A0A1W2PRG6	482 aa		14.18	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF716	A6NP11	495 aa		14.18	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	PPP1R3D	O95685	299 aa		14.18	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	14.18	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	CRISP1	P54107	249 aa		14.18	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	PER3	P56645	1201 aa		14.18	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	14.18	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	SLC17A1	Q14916	467 aa		14.18	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		14.18	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	RTL6	Q6ICC9	239 aa		14.18	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	PXK	Q7Z7A4	578 aa		14.18	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		14.18	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		14.18	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF570	Q96NI8	536 aa		14.18	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	RDH12	Q96NR8	316 aa		14.18	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	14.18	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	TM9SF2	Q99805	663 aa		14.18	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		14.18	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		14.18	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		14.18	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	TOR3A	Q9H497	397 aa		14.18	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	RNF122	Q9H9V4	155 aa		14.18	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	FANCF	Q9NPI8	374 aa		14.18	□□□□□ -0.14
LTBP4-222	ENST00000598256	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		14.18	□□□□□ -0.14

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