RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 ORAI3Q9BRQ5 295 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 BABAM2Q9NXR7 383 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 TOXO94900 526 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 SRP9P49458 86 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 ERVK-25P63136 954 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 CCINQ13939 588 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 GAS6Q14393 721 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 EIPR1Q53HC9 387 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 SAMD12Q8N8I0 201 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 SMPDL3BQ92485 455 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 GSX2Q9BZM3 304 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 DUSP22Q9NRW4 184 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 MMP17Q9ULZ9 603 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 GPANK1O95872 356 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 HLA-DPB1P04440 258 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 WNT1P04628 370 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 OR4D9Q8NGE8 314 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 KLHDC7BQ96G42 594 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 MSLNLQ96KJ4 702 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 SORCS2Q96PQ0 1159 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 HDHD2Q9H0R4 259 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 LMAN2LQ9H0V9 348 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 FBXL2Q9UKC9 423 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 ADAM30Q9UKF2 790 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 RASD1Q9Y272 281 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 H7C2Y5 167 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 MAP2K3P46734 347 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 RTL4Q6ZR62 310 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 GAL3ST4Q96RP7 486 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 OR8D2Q9GZM6 311 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 SLC22A11Q9NSA0 550 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 POT1Q9NUX5 634 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 NTMQ9P121 344 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 EXTL2Q9UBQ6 330 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 FKBP7Q9Y680 259 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 FAM86C2PA6NEL3 165 aa13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 RIIAD1A6NNX1 92 aa13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 TNFRSF10CO14798 259 aa13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 SELENOFO60613 162 aa13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 KDM4BO94953 1096 aa13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 WDPCPO95876 746 aa13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 CSTAP01040 98 aa13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 F13BP05160 661 aa13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 SYPP08247 313 aa13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 RABIFP47224 123 aa13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 DEFA5Q01523 94 aa13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 TRIQKQ629K1 86 aa13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 GJD3Q8N144 294 aa13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 LNX2Q8N448 690 aa13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 C19orf18Q8NEA5 215 aa13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 CXorf58Q96LI9 332 aa13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 LYRM4Q9HD34 91 aa13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 ASB6Q9NWX5 421 aa13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 CTSFQ9UBX1 484 aa13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 SESN1Q9Y6P5 492 aa13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 STMND1H3BQB6 276 aa13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 TFP02787 698 aa13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 ZNF85Q03923 595 aa13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 C5orf46Q6UWT4 87 aa13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 TTLL10Q6ZVT0 673 aa13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 KRT74Q7RTS7 529 aa13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 C2CD4CQ8TF44 421 aa13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 GHSRQ92847 366 aa13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 TSLPQ969D9 159 aa13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 CTHRC1Q96CG8 243 aa13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 ZFP3Q96NJ6 502 aa13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 SLC38A3Q99624 504 aa13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 SLC19A3Q9BZV2 496 aa13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 BEX1Q9HBH7 125 aa13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 PCNX3Q9H6A9 2034 aa13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 URB1O60287 2271 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 A0A0B4J2E0 115 aa13.77□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 A0A1B0GTH9 108 aa13.77□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 A0A1B0GX12 115 aa13.77□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 RPP14O95059 124 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 IGHA1P01876 353 aa13.77□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 THBS1P07996 1170 aa13.77□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 SBK2P0C263 348 aa13.77□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 CD226Q15762 336 aa13.77□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 ZNF511Q8NB15 262 aa13.77□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 SMRP1Q8NCR6 262 aa13.77□□□□□ -0.2
CTIF-205ENST00000587860 ADGRL4Q9HBW9 690 aa13.77□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms