RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 SELENOPP49908 381 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 CDH12P55289 794 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 CLDN17P56750 224 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 PRPS1P60891 318 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 EGR4Q05215 589 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 LSAMPQ13449 338 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 GABRA6Q16445 453 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 DUSP7Q16829 419 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 VMACQ2NL98 169 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 RABL3Q5HYI8 236 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 Q5PR19 223 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 FAM69AQ5T7M9 428 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 REP15Q6BDI9 236 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 NANOGP8Q6NSW7 305 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 HMBOX1Q6NT76 420 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 SLC22A25Q6T423 547 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM108Q6UXF1 575 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 COMTD1Q86VU5 262 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 SNX32Q86XE0 403 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 ZIC4Q8N9L1 334 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 KBTBD8Q8NFY9 601 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 FAM81AQ8TBF8 368 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 RASSF5Q8WWW0 418 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 NEUROG1Q92886 237 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 TAAR8Q969N4 342 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM45BQ96B21 275 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 MUS81Q96NY9 551 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 OXGR1Q96P68 337 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM204Q9BSN7 226 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 ASPNQ9BXN1 380 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 C1orf21Q9H246 121 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 ALG2Q9H553 416 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 NANOGQ9H9S0 305 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 ARL8BQ9NVJ2 186 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 TAS2R1Q9NYW7 299 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 MALT1Q9UDY8 824 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 ROS1P08922 2347 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 A0A087WUJ7 227 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 OR6C65A6NJZ3 312 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 BBIP1A8MTZ0 92 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF587BE7ETH6 402 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 M0R082 166 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 GYG2O15488 501 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 FKBP6O75344 327 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 SLC43A1O75387 559 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 OR6A2O95222 327 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 LGI1O95970 557 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 WNT11O96014 354 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 NPPAP01160 153 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 IFNA14P01570 189 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 C8BP07358 591 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 LYNP07948 512 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 ITGA5P08648 1049 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 PTAFRP25105 342 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 GRPRP30550 384 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 PCGF2P35227 344 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 PTH2RP49190 550 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 P2RY4P51582 365 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 ATP5J2P56134 94 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 RIPPLY3P57055 190 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 PMS2P3Q13401 168 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 MFSD13AQ14CX5 517 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 RCN1Q15293 331 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 COQ5Q5HYK3 327 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 ENTPD8Q5MY95 495 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 FOXB2Q5VYV0 432 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 EPHX4Q8IUS5 362 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 UEVLDQ8IX04 471 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 GPR137CQ8N3F9 429 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 OR8J3Q8NGG0 315 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 OR6T1Q8NGN1 323 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF417Q8TAU3 575 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 PROX1Q92786 737 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 PPP1R14BQ96C90 147 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 RADILQ96JH8 1075 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 Q96MF0 132 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 ARHGDIGQ99819 225 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 WFDC6Q9BQY6 131 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 PTDSS2Q9BVG9 487 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 GSX2Q9BZM3 304 aa7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms