RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580654.5

SMARCE1-217, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-217ENST00000580654 SVIPQ8NHG7 77 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 ZFP28Q8NHY6 868 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 KIF18AQ8NI77 898 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 RAB1CQ92928 201 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 CHMP6Q96FZ7 201 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF382Q96SR6 550 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 OSBPL9Q96SU4 736 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 SDF2Q99470 211 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 MRI1Q9BV20 369 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 NMUR2Q9GZQ4 415 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 NPHS2Q9NP85 383 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 TENM2Q9NT68 2774 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 UBAP1Q9NZ09 502 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 TAAR3PQ9P1P4 343 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 TRAV40A0A0B4J280 105 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 LIPT2A6NK58 231 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 A8MXK9 166 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF208O43345 1280 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 PIP5K1CO60331 668 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 TBX19O60806 448 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF432O94892 652 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 PPP1R3DO95685 299 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 HLA-HP01893 362 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 RBP1P09455 135 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 FAM157BP0CG42 384 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 MAKP20794 623 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 RYKP34925 604 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 MAGEA12P43365 314 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 SLC6A9P48067 706 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 FOXA1P55317 472 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 TEKQ02763 1124 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 PAX2Q02962 417 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 PDE7AQ13946 482 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 CEACAM7Q14002 265 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 KIAA0040Q15053 153 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 GPR68Q15743 365 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 PCGF3Q3KNV8 242 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 FAM205BPQ63HN1 556 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 BRD3OSQ6XYD6 125 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 KLHL7Q8IXQ5 586 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 OR5D16Q8NGK9 328 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF563Q8TA94 476 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 ST7LQ8TDW4 575 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 UPRTQ96BW1 309 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 TIMD4Q96H15 378 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 CITED4Q96RK1 184 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 ACTRT3Q9BYD9 372 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 GPR35Q9HC97 309 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 DCAF16Q9NXF7 216 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF224Q9NZL3 707 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 OSGIN1Q9UJX0 560 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 PCDHGB4Q9UN71 923 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 SNX24Q9Y343 169 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 TMED7Q9Y3B3 224 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 ISPDA4D126 451 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 K7EIL1 84 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 AP3D1O14617 1153 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 DHHO43323 396 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 AKAP10O43572 662 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 SUPT7LO94864 414 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 UBOX5O94941 541 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 IGHV2-70P01814 119 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 MELTFP08582 738 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 GSTA2P09210 222 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 PPIAL4GP0DN37 164 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 CAPZA2P47755 286 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 ERVS71-1P61550 626 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 RPS23P62266 143 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 DR1Q01658 176 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 PIGFQ07326 219 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 OR7A5Q15622 319 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 TSTQ16762 297 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 CEACAM16Q2WEN9 425 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 HFEQ30201 348 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 SPRNQ5BIV9 151 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 TMEM255AQ5JRV8 349 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 PHYHD1Q5SRE7 291 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF678Q5SXM1 525 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 AP1ARQ63HQ0 302 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-217ENST00000580654 TMEM154Q6P9G4 183 aa6.44□□□□□ -1.38
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