RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 C2orf76Q3KRA6 126 aa19.78■□□□□ 0.76
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PTPRM-211ENST00000580170 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
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PTPRM-211ENST00000580170 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM38AQ9H6F2 299 aa19.75■□□□□ 0.75
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