RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 SH3PXD2BA1X283 911 aa29.34■■■□□ 2.29
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MAKP20794 623 aa29.34■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCYT1AP49585 367 aa29.34■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZP4Q12836 540 aa29.34■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 CASP12Q6UXS9 341 aa29.34■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa29.34■■■□□ 2.29
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CTDNEP1-209ENST00000574205 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa29.34■■■□□ 2.29
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CTDNEP1-209ENST00000574205 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa29.32■■■□□ 2.28
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 TSPAN19P0C672 248 aa29.31■■■□□ 2.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 POU2F1P14859 743 aa29.31■■■□□ 2.28
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CTDNEP1-209ENST00000574205 RCE1Q9Y256 329 aa29.31■■■□□ 2.28
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CTDNEP1-209ENST00000574205 Q6ZT83 130 aa29.3■■■□□ 2.28
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZSCAN26Q16670 478 aa29.27■■■□□ 2.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBE2J2Q8N2K1 259 aa29.27■■■□□ 2.28
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa29.27■■■□□ 2.28
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CTDNEP1-209ENST00000574205 U3KQV3 271 aa29.27■■■□□ 2.28
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CTDNEP1-209ENST00000574205 OR51A7Q8NH64 312 aa29.26■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
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CTDNEP1-209ENST00000574205 COL8A1P27658 744 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 UGT2B10P36537 528 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACTR3P61158 418 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 FHL1Q13642 323 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 LAPTM4AQ15012 233 aa29.25■■■□□ 2.27
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