RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565975.5

SPNS1-207, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,979 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-207ENST00000565975 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 UCKL1Q9NWZ5 548 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 GRHPRQ9UBQ7 328 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 PIN1P1O15428 100 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 TSPAN2O60636 221 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 SDC3O75056 442 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 HIST1H2ABP04908 130 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 FBLP22087 321 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 IL12BP29460 328 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 OR1D5P58170 312 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 ZNF117Q03924 483 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 NTRK2Q16620 822 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 SYT9Q86SS6 491 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 CDC20BQ86Y33 519 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 OR4D9Q8NGE8 314 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.847e-8■■□□□ 11.5
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SPNS1-207ENST00000565975 HIST1H2ACQ93077 130 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 BEX2Q9BXY8 128 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 DPAGT1Q9H3H5 408 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 SLA2Q9H6Q3 261 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 A0A1B0GVT2 93 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 PRR32B1ATL7 298 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 ITGA10O75578 1167 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 SERPINI2O75830 405 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 ZNF511Q8NB15 262 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 ZNF524Q96C55 264 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 TSPAN32Q96QS1 320 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 GAL3ST4Q96RP7 486 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 MRI1Q9BV20 369 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 ZNF304Q9HCX3 659 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 PRDM6Q9NQX0 595 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 CUL9Q8IWT3 2517 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 OR6C70A6NIJ9 312 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 ALG1L2C9J202 215 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 DUX1O43812 170 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 RENP00797 406 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 C1QBP02746 253 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 MESTQ5EB52 335 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 C9orf40Q8IXQ3 194 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 PRR22Q8IZ63 422 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 ZNF671Q8TAW3 534 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 TAAR8Q969N4 342 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
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SPNS1-207ENST00000565975 SPTBP11277 2137 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 OR6C76A6NM76 312 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 FAM171A2A8MVW0 826 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 AIPO00170 330 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 UPK3AO75631 287 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 DHFRP00374 187 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 F13BP05160 661 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 GZMKP49863 264 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 UBXN2BQ14CS0 331 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 SNAP47Q5SQN1 464 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 TOMM5Q8N4H5 51 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 LGALS14Q8TCE9 139 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 SLC41A2Q96JW4 573 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 TSSK2Q96PF2 358 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 TMEM246Q9BRR3 403 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 COPZ2Q9P299 210 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 NUP210LQ5VU65 1888 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 A0A0B4J203 849 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 TMEM72A0PK05 275 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 C4orf47A7E2U8 309 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 HSPB2A8KAH6 182 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 IDSB3KWA1 339 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 AGRPO00253 132 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 HCRTR2O43614 444 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 ZFPL1O95159 310 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 BGLAPP02818 100 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 CXCR1P25024 350 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 EFNA3P52797 238 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 HSPB2Q16082 182 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 UTS2BQ765I0 119 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 KRT74Q7RTS7 529 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 MAP6Q96JE9 813 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 WWTR1Q9GZV5 400 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 COPS7AQ9UBW8 275 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-207ENST00000565975 C7orf66A4D0T2 115 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-207ENST00000565975 IFITM5A6NNB3 132 aa20.26■□□□□ 0.83
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