RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 SLC18A1P54219 525 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 TUBA1BP68363 451 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 TUBA4AP68366 448 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 HGFACQ04756 655 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 EGR4Q05215 589 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 FADDQ13158 208 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 SQLEQ14534 574 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 FAM69AQ5T7M9 428 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 LIPNQ5VXI9 398 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 C5orf46Q6UWT4 87 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 THSD4Q6ZMP0 1018 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 TUBA1AQ71U36 451 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 LINGO2Q7L985 606 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 SPATA21Q7Z572 469 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 KRT73Q86Y46 540 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 MIER2Q8N344 545 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 PIK3C3Q8NEB9 887 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 BBS10Q8TAM1 723 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 MGARPQ8TDB4 240 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 GTF2H4Q92759 462 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 SLC38A4Q969I6 547 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 TAAR8Q969N4 342 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 DOK1Q99704 481 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 PTDSS2Q9BVG9 487 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 ZNF442Q9H7R0 627 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 C12orf10Q9HB07 376 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 CRLF2Q9HC73 371 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 SELENONQ9NZV5 590 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 CHST2Q9Y4C5 530 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 SPEF1Q9Y4P9 236 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 SH3PXD2BA1X283 911 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 MS4A18H0YCH9 400 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 hCG_2039718K7EN88 272 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 M0R082 166 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 STAMBPO95630 424 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 IGKV3-15P01624 115 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 ETS2P15036 469 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 NQO1P15559 274 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 IGFBP5P24593 272 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 GIFP27352 417 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 PRKAR1BP31321 381 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 THBS4P35443 961 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 CAPZA2P47755 286 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 CHN2P52757 468 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 DAG1Q14118 895 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 MFSD13AQ14CX5 517 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 CEACAM16Q2WEN9 425 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 MS4A18Q3C1V0 323 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 GTDC1Q4AE62 458 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 ULK3Q6PHR2 472 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 UGT2A3Q6UWM9 527 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 C6orf89Q6UWU4 347 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 SNX32Q86XE0 403 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 LSMEM1Q8N8F7 131 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 ZNF417Q8TAU3 575 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 RNF217Q8TC41 542 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 HPS1Q92902 700 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 MAL2Q969L2 176 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 SLC47A1Q96FL8 570 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 LRR1Q96L50 414 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 OR2M2Q96R28 347 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 OR52B2Q96RD2 323 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 EPYCQ99645 322 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 BPESC1Q9GZL8 116 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 TMEM27Q9HBJ8 222 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 RAB21Q9UL25 225 aa7.07□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 CR1P17927 2039 aa7.06□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa7.06□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 A0A1B0GWA3 101 aa7.06□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 TMEM129A0AVI4 362 aa7.06□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 PRORSD1PA6NEY8 169 aa7.06□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 ZNF726A6NNF4 738 aa7.06□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 M0R3G1 203 aa7.06□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 TGDSO95455 350 aa7.06□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 CELA3BP08861 270 aa7.06□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 ADRA2AP08913 450 aa7.06□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 CD79AP11912 226 aa7.06□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 BMP2P12643 396 aa7.06□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 CBLP22681 906 aa7.06□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 NR4A1P22736 598 aa7.06□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 PPIBP23284 216 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 SLC6A2P23975 617 aa7.06□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 GRPRP30550 384 aa7.06□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 STX1BP61266 288 aa7.06□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms