RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555806.5

NEDD1-208, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-208ENST00000555806 RASSF5Q8WWW0 418 aa16.11■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 DHRS9Q9BPW9 319 aa16.11■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 TMEM43Q9BTV4 400 aa16.11■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 FKRPQ9H9S5 495 aa16.11■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 ATP23Q9Y6H3 246 aa16.11■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 CAPN7Q9Y6W3 813 aa16.11■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 NF1P21359 2839 aa16.11■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 ZFHX3Q15911 3703 aa16.1■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 A0A096LPE4 126 aa16.1■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 LOC100653049A0A140TA62 436 aa16.1■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 A0A1W2PPZ6 126 aa16.1■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 LRRN3E7EW58 273 aa16.1■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 FXYD1O00168 92 aa16.1■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 KRT34O76011 436 aa16.1■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF432O94892 652 aa16.1■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 GZMMP51124 257 aa16.1■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 FABP6P51161 128 aa16.1■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 LTBQ06643 244 aa16.1■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 PMS2P3Q13401 168 aa16.1■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 VEZF1Q14119 521 aa16.1■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 B3GLCTQ6Y288 498 aa16.1■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 FBXL14Q8N1E6 418 aa16.1■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 SCAIQ8N9R8 606 aa16.1■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa16.1■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 OR4D11Q8NGI4 311 aa16.1■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 HS6ST2Q96MM7 605 aa16.1■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 MOGAT1Q96PD6 335 aa16.1■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 CCDC134Q9H6E4 229 aa16.1■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 OBP2BQ9NPH6 170 aa16.1■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 MED4Q9NPJ6 270 aa16.1■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 HPRP00739 348 aa16.09■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 NPPAP01160 153 aa16.09■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 CD8AP01732 235 aa16.09■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 TTKP33981 857 aa16.09■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 TUBA1BP68363 451 aa16.09■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 TUBA4AP68366 448 aa16.09■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 ETFDHQ16134 617 aa16.09■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 CLEC12BQ2HXU8 276 aa16.09■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 CARD17Q5XLA6 110 aa16.09■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 ANKRD16Q6P6B7 361 aa16.09■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 TUBA1AQ71U36 451 aa16.09■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 CCDC80Q76M96 950 aa16.09■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 CALHM3Q86XJ0 350 aa16.09■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 PIK3C3Q8NEB9 887 aa16.09■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa16.09■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 PROX1Q92786 737 aa16.09■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 SLC41A3Q96GZ6 507 aa16.09■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 OR2M2Q96R28 347 aa16.09■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 GID8Q9NWU2 228 aa16.09■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
NEDD1-208ENST00000555806 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa16.08■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 TRAPPC13A5PLN9 417 aa16.08■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa16.08■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 MS4A18H0YCH9 400 aa16.08■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 SERPINI2O75830 405 aa16.08■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 LY6G6DO95868 133 aa16.08■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 HEXAP06865 529 aa16.08■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 HLA-DOBP13765 273 aa16.08■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 AHCYP23526 432 aa16.08■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 ARF1P84077 181 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 PUDPQ08623 228 aa16.08■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 MS4A18Q3C1V0 323 aa16.08■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 ERICH5Q6P6B1 374 aa16.08■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 MUC15Q8N387 334 aa16.08■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 BOD1Q96IK1 185 aa16.08■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 KCNS3Q9BQ31 491 aa16.08■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 EMC6Q9BV81 110 aa16.08■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 CACNG6Q9BXT2 260 aa16.08■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 GRIP2Q9C0E4 1043 aa16.08■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 CRLF2Q9HC73 371 aa16.08■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 GPR35Q9HC97 309 aa16.08■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 CBLN4Q9NTU7 201 aa16.08■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 ARMCX1Q9P291 453 aa16.08■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 SLC7A7Q9UM01 511 aa16.08■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 USP22Q9UPT9 525 aa16.08■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa16.07■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 M0R3G1 203 aa16.07■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 NDUFS7O75251 213 aa16.07■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 OR6A2O95222 327 aa16.07■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 MT-ATP6P00846 226 aa16.07■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 IGHV4-39P01824 125 aa16.07■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 ACVR1BP36896 505 aa16.07■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 MDH1P40925 334 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 CRYBA2P53672 197 aa16.07■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 TNK1Q13470 666 aa16.07■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 CEACAM16Q2WEN9 425 aa16.07■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF544Q6NX49 715 aa16.07■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 LINC00114Q6XXX2 140 aa16.07■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 WDR88Q6ZMY6 472 aa16.07■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 CARM1Q86X55 608 aa16.07■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 TMEM123Q8N131 208 aa16.07■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 POU5F2Q8N7G0 328 aa16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms