RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	ERF	P50548	548 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	MAP2K6	P52564	334 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	CRYBA2	P53672	197 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	SESN3	P58005	492 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	PRPS1	P60891	318 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	SPOCK1	Q08629	439 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	VMAC	Q2NL98	169 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	MST1L	Q2TV78	715 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	CR1L	Q2VPA4	569 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	SYT14P1	Q58G82	188 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	MICU2	Q8IYU8	434 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	HIPK4	Q8NE63	616 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	OR2T12	Q8NG77	320 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	TAMM41	Q96BW9	452 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	NSL1	Q96IY1	281 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	TPD52L3	Q96J77	140 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	ZNF583	Q96ND8	569 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	MRGBP	Q9NV56	204 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	CALML5	Q9NZT1	146 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	UPB1	Q9UBR1	384 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	CDHR4	A6H8M9	788 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	VSTM5	A8MXK1	200 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688		B9A039	149 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	PDLIM1	O00151	329 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	ZNF682	O95780	498 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	IGHV3-9	P01782	118 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	GUSB	P08236	651 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	T-ENOL	P0DO92	83 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	TFPI	P10646	304 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	GIF	P27352	417 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	HTR2A	P28223	471 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	MPG	P29372	298 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	SERPINF1	P36955	418 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	OR1E2	P47887	323 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	CHN2	P52757	468 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	H3F3A	P84243	136 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	MERTK	Q12866	999 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	BNIP2	Q12982	314 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	SCGB2A2	Q13296	93 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	GNA13	Q14344	377 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	KRT72	Q14CN4	511 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	DUSP7	Q16829	419 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	KRT73	Q86Y46	540 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	WDR31	Q8NA23	367 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	FAM162A	Q96A26	154 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	C3orf49	Q96BT1	292 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	FBXO17	Q96EF6	278 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	BOD1	Q96IK1	185 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	CDRT15	Q96T59	188 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	SH3GL1	Q99961	368 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		5.98	□□□□□ -1.45

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