RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534730.5

BBS1-224, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 627 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-224	ENST00000534730	P3H2	Q8IVL5	708 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM99	Q8N816	258 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	DOCK7	Q96N67	2140 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	RCE1	Q9Y256	329 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	UNC119B	A6NIH7	251 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF726	A6NNF4	738 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	CENPBD1	B2RD01	187 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	AQP8	O94778	261 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	NDUFB2	O95178	105 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF23	P17027	643 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	PEX19	P40855	299 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	FNDC8	Q8TC99	324 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	ABHD3	Q8WU67	409 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM45B	Q96B21	275 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	INIP	Q9NRY2	104 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	PROCR	Q9UNN8	238 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	MED12L	Q86YW9	2145 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	AKAP9	Q99996	3911 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730		A6NIZ1	184 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	BAG2	O95816	211 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	CD8B	P10966	210 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	CBL	P22681	906 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	SLC6A6	P31641	620 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	GPR4	P46093	362 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	GSS	P48637	474 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	RAP1B	P61224	184 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	RAP1A	P62834	184 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	SEC23B	Q15437	767 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	ALG10	Q5BKT4	473 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	APH1A	Q96BI3	265 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	CCDC120	Q96HB5	630 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730		A0A0G2JNJ9	132 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF716	A6NP11	495 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	MSTN	O14793	375 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	ZNHIT1	O43257	154 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	IDH3B	O43837	385 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	BCL10	O95999	233 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	TSPAN19	P0C672	248 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	AGTR1	P30556	359 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	UQCRC1	P31930	480 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	PCYT1A	P49585	367 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	RPS6KA3	P51812	740 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	LTB	Q06643	244 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	BEND4	Q6ZU67	534 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	AAED1	Q7RTV5	226 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	CCDC103	Q8IW40	242 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		13.59	□□□□□ -0.23

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