RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 CLINT1Q14677 625 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 FCRLBQ6BAA4 426 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 OR2W3Q7Z3T1 314 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 CEACAM19Q7Z692 300 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 NUDT13Q86X67 352 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 SIRT6Q8N6T7 355 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 WDSUB1Q8N9V3 476 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM38AQ9H6F2 299 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 THADAQ6YHU6 1953 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 PRMT3O60678 531 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ATP6V1E1P36543 226 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 RAB5BP61020 215 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 SKP2Q13309 424 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 PRSS53Q2L4Q9 553 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 C14orf28Q4W4Y0 310 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 BEND4Q6ZU67 534 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 OLIG3Q7RTU3 272 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 PRSS33Q8NF86 280 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 OR4K5Q8NGD3 323 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 TIMP4Q99727 224 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 TAS2R5Q9NYW4 299 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 M0R3H8 397 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 CHST10O43529 356 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 SLC2A10O95528 541 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 BCHEP06276 602 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 PPIAP62937 165 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 IRF8Q02556 426 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 SLC3A1Q07837 685 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 AGERQ15109 404 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 RPTNQ6XPR3 784 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 TPRA1Q86W33 373 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 MISPQ8IVT2 679 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ARMC10Q8N2F6 343 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 POGLUT1Q8NBL1 392 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 DEFB124Q8NES8 71 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 SMPDL3AQ92484 453 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 FCRL4Q96PJ5 515 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 LRRC61Q9BV99 259 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 POT1Q9NUX5 634 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 FAM183AA6NL82 134 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 DCTDP32321 178 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 AKR1C3P42330 323 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 AKIRIN2Q53H80 203 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 STX12Q86Y82 276 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 C17orf47Q8NEP4 570 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 CCL4L1Q8NHW4 92 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 BBS10Q8TAM1 723 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 MEGF10Q96KG7 1140 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 PINK1Q9BXM7 581 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 PCBD2Q9H0N5 130 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 PIGMQ9H3S5 423 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 XKR8Q9H6D3 395 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 UFSP2Q9NUQ7 469 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 PI4KAP42356 2102 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 GFYI3L273 518 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 OBSL1O75147 1896 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ARAFP10398 606 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ART1P52961 327 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 FAM122BQ7Z309 247 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 OR6V1Q8N148 313 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 OR9A1PQ8NGU1 263 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 RAB8BQ92930 207 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 C14orf144Q96I85 54 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 TGM7Q96PF1 710 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM185BQ9H7F4 350 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 IL21RQ9HBE5 538 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 C2orf74A8MZ97 194 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 SOCS6O14544 535 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 PNLIPRP2P54317 469 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 SKP1P63208 163 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 PITPNAQ00169 270 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 OR51G2Q8NGK0 314 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 CNIH4Q9P003 139 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 METTL21EPA6NDL7 271 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 C5orf58C9J3I9 102 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 F5H5P2 479 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 OR8U8P0C7N1 319 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 MPC1LP0DKB6 136 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 NQO2P16083 231 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ABCD3P28288 659 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ACVR1BP36896 505 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 DLX5P56178 289 aa9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms