RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520057.1

IGHV3-62-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-62 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHV3-62, Length 340 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-62-201ENST00000520057 THY1P04216 161 aa14.52□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 ITGA5P08648 1049 aa14.52□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 LTBQ06643 244 aa14.52□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 KRT72Q14CN4 511 aa14.52□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 GABRA6Q16445 453 aa14.52□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 CARD17Q5XLA6 110 aa14.52□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa14.52□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 RRM2BQ7LG56 351 aa14.52□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 PXKQ7Z7A4 578 aa14.52□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 NKAIN4Q8IVV8 208 aa14.52□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 DEFB107AQ8IZN7 70 aa14.52□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 C17orf78Q8N4C9 275 aa14.52□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 ANKK1Q8NFD2 765 aa14.52□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 TMEM255BQ8WV15 326 aa14.52□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 SGTBQ96EQ0 304 aa14.52□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 NSL1Q96IY1 281 aa14.52□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 HS3ST6Q96QI5 342 aa14.52□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 B3GAT1Q9P2W7 334 aa14.52□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 AMDHD2Q9Y303 409 aa14.52□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 RNF115Q9Y4L5 304 aa14.52□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 B2RBV5 119 aa14.51□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 MS4A18H0YCH9 400 aa14.51□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 UPK3AO75631 287 aa14.51□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 PRPS1P60891 318 aa14.51□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 ACKR1Q16570 336 aa14.51□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 MS4A18Q3C1V0 323 aa14.51□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 TMEM108Q6UXF1 575 aa14.51□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 CDK20Q8IZL9 346 aa14.51□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 DEPDC4Q8N2C3 294 aa14.51□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 FITM2Q8N6M3 262 aa14.51□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 OR6N1Q8NGY5 312 aa14.51□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 PIGTQ969N2 578 aa14.51□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 MUS81Q96NY9 551 aa14.51□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 PRSS27Q9BQR3 290 aa14.51□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 EMC6Q9BV81 110 aa14.51□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 LINC00470Q9BZP3 86 aa14.51□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa14.51□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 RHCGQ9UBD6 479 aa14.51□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa14.51□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 SLC35F4A4IF30 521 aa14.5□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 M0R1B8 84 aa14.5□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 M0R3G1 203 aa14.5□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 FZD7O75084 574 aa14.5□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 LYPD3O95274 346 aa14.5□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 HPRP00739 348 aa14.5□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 FUT1P19526 365 aa14.5□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 ZNF83P51522 516 aa14.5□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 BSPH1Q075Z2 132 aa14.5□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 TRAM2Q15035 370 aa14.5□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 NCMAPQ5T1S8 102 aa14.5□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 C20orf204Q6ZNR8 217 aa14.5□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 FAM156AQ8NDB6 213 aa14.5□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 PFN4Q8NHR9 129 aa14.5□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 BCAS4Q8TDM0 211 aa14.5□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 MCUR1Q96AQ8 359 aa14.5□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 NSMCE2Q96MF7 247 aa14.5□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 CCL19Q99731 98 aa14.5□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 ZNF426Q9BUY5 554 aa14.5□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa14.5□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 MED29Q9NX70 200 aa14.5□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 POU2F3Q9UKI9 436 aa14.5□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 NAV2Q8IVL1 2488 aa14.5□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 A0A1W2PPR1 153 aa14.49□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 A0A1W2PRG6 482 aa14.49□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 MCIDASD6RGH6 385 aa14.49□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 PDLIM1O00151 329 aa14.49□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 OR7A10O76100 309 aa14.49□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 ATE1O95260 518 aa14.49□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 IFI30P13284 250 aa14.49□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 HLA-DOBP13765 273 aa14.49□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 HSD17B1P14061 328 aa14.49□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 CALB2P22676 271 aa14.49□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 CAPZA2P47755 286 aa14.49□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 UGT2B15P54855 530 aa14.49□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 BIDP55957 195 aa14.49□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 LGALS3BPQ08380 585 aa14.49□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 CAMK2DQ13557 499 aa14.49□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 ZNF730Q6ZMV8 503 aa14.49□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 SLC35D2Q76EJ3 337 aa14.49□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 OFCC1Q8IZS5 231 aa14.49□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 LRRC17Q8N6Y2 441 aa14.49□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 OR2M2Q96R28 347 aa14.49□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 CRLF2Q9HC73 371 aa14.49□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 SLC17A5Q9NRA2 495 aa14.49□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 A4GNTQ9UNA3 340 aa14.49□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 MGAT4BQ9UQ53 548 aa14.49□□□□□ -0.09
IGHV3-62-201ENST00000520057 SLC25A15Q9Y619 301 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 498.6 ms