RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-222	ENST00000514552	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		6	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	ADGRG7	Q96K78	797 aa		6	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		6	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	HBEGF	Q99075	208 aa		6	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	SMR3A	Q99954	134 aa		6	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		6	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	PINK1	Q9BXM7	581 aa		6	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		6	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	6	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	DSN1	Q9H410	356 aa		6	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		6	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		6	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	6	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		6	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	6	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		6	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		6	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	ROS1	P08922	2347 aa		6	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	CUBN	O60494	3623 aa		6	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552		A0A1W2PQD3	144 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	ADAMDEC1	O15204	470 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	SCO2	O43819	266 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	ANGPTL1	O95841	491 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	LY6G6D	O95868	133 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	CTAGE8	P0CG41	777 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	ME2	P23368	584 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	MAP3K8	P41279	467 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	CENPA	P49450	140 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	ENTPD1	P49961	510 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	CDH12	P55289	794 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	CLDN20	P56880	219 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	ZP1	P60852	638 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	PPP2R2B	Q00005	443 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM107	Q6UX40	140 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	MNS1	Q8NEH6	495 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	HTRA1	Q92743	480 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	ZBTB9	Q96C00	473 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	ELP4	Q96EB1	424 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	FUZ	Q9BT04	418 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	GAGE10	A6NGK3	116 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	TEX22	C9J3V5	150 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552		H0YC42	278 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	HS3ST1	O14792	307 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	SEC14L5	O43304	696 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	AQP8	O94778	261 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	SOX30	O94993	753 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	NKX2-2	O95096	273 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	UTS2	O95399	124 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	TUBB	P07437	444 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	PRPS2	P11908	318 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	NEFH	P12036	1026 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	TSPAN8	P19075	237 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	RFX2	P48378	723 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	HTR6	P50406	440 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	CTBP2	P56545	445 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	LINC00205	P59089	165 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	SIRPA	P78324	504 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC18A2	Q05940	514 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	C2orf80	Q0P641	193 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	PDE7A	Q13946	482 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	SGCB	Q16585	318 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	IMPG1	Q17R60	797 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	TEX45	Q8NA69	505 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PDE4D-222	ENST00000514552	OR10D3	Q8NH80	312 aa		5.98	□□□□□ -1.45

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