RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CDH12P55289 794 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CHRNB3Q05901 458 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 METTL21CQ5VZV1 264 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC38A2Q96QD8 506 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MCHR1Q99705 422 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ASPNQ9BXN1 380 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 M0R3H8 397 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SASH3O75995 380 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TUBA1BP68363 451 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TUBA4AP68366 448 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARF1P84077 181 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DUSP7Q16829 419 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TUBA1AQ71U36 451 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UEVLDQ8IX04 471 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PIK3C3Q8NEB9 887 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR6S1Q8NH40 331 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HTRA1Q92743 480 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CORINQ9Y5Q5 1042 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MS4A18H0YCH9 400 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CRYAAP02489 173 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TP53P04637 393 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PMS2P3Q13401 168 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MS4A18Q3C1V0 323 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DNM1P46Q6ZS02 220 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC30A8Q8IWU4 369 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANKK1Q8NFD2 765 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR10A6Q8NH74 314 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC26A7Q8TE54 656 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR2M2Q96R28 347 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARHGDIGQ99819 225 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GPR35Q9HC97 309 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CR1P17927 2039 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BGLAPP02818 100 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C8BP07358 591 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CEACAM16Q2WEN9 425 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CARD17Q5XLA6 110 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF613Q6PF04 617 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CLEC2AQ6UVW9 174 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SCAIQ8N9R8 606 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GPR32P1Q8NGA4 272 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FBXO17Q96EF6 278 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC41A3Q96GZ6 507 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM43Q9BTV4 400 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CRLF2Q9HC73 371 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 H7C417 338 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 M0R3G1 203 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FMO6PO60774 539 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HPRP00739 348 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HLA-DOBP13765 273 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DSCR9P59020 149 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR6T1Q8NGN1 323 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MOGAT1Q96PD6 335 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EMC6Q9BV81 110 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KATNB1Q9BVA0 655 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NELFAQ9H3P2 528 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 JMJD1CQ15652 2540 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ABCA2Q9BZC7 2435 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LRRN3E7EW58 273 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AHCYP23526 432 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PCGF2P35227 344 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP1-1Q07627 177 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ENTPD8Q5MY95 495 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM123Q8N131 208 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NOX1Q9Y5S8 564 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF726A6NNF4 738 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FBP2O00757 339 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CHP2O43745 196 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SERPINI2O75830 405 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CECR9P0C854 216 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CAPZA2P47755 286 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NAAAQ02083 359 aa20.3■□□□□ 0.84
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