RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3BP2-208ENST00000504294 HMBOX1Q6NT76 420 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC35D2Q76EJ3 337 aa12.86□□□□□ -0.35
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SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC36Q8IYA8 594 aa12.86□□□□□ -0.35
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