RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 FAM69AQ5T7M9 428 aa15.16■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 C1orf140Q5VVS0 124 aa15.16■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 SLC23A3Q6PIS1 610 aa15.16■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 TMEM205Q6UW68 189 aa15.16■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 EXD3Q8N9H8 876 aa15.16■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 GALNT6Q8NCL4 622 aa15.16■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 AGBL5Q8NDL9 886 aa15.16■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 OR13C5Q8NGS8 318 aa15.16■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 THAP4Q8WY91 577 aa15.16■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 CPNE5Q9HCH3 593 aa15.16■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 DCTN6O00399 190 aa15.15■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 HPGDSO60760 199 aa15.15■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 MT-ATP6P00846 226 aa15.15■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 SYPP08247 313 aa15.15■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 AHCYP23526 432 aa15.15■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 SIRPAP78324 504 aa15.15■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 C17orf67Q0P5P2 114 aa15.15■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 BAK1Q16611 211 aa15.15■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 ACSM3Q53FZ2 586 aa15.15■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 BICRALQ6AI39 1079 aa15.15■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 GPR139Q6DWJ6 353 aa15.15■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 TMEM105Q8N8V8 129 aa15.15■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 MOKQ9UQ07 419 aa15.15■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa15.15■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 PSMD9O00233 223 aa15.15■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 OGG1O15527 345 aa15.15■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 ARHGEF9O43307 516 aa15.15■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 NPIPB7O75200 414 aa15.15■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 ZFAND5O76080 213 aa15.15■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 PLGP00747 810 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 CCL4P13236 92 aa15.15■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 SPNP16150 400 aa15.15■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 GDI2P50395 445 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 CDK5R1Q15078 307 aa15.15■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa15.15■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 NR2C2APQ86WQ0 139 aa15.15■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 MS4A15Q8N5U1 240 aa15.15■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 TMEM234Q8WY98 164 aa15.15■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 HGDQ93099 445 aa15.15■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa15.14■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 TMCC2O75069 709 aa15.14■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 RENP00797 406 aa15.14■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 MYL9P24844 172 aa15.14■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 PSMB10P40306 273 aa15.14■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 SGCBQ16585 318 aa15.14■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 IDNKQ5T6J7 187 aa15.14■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 MZT2AQ6P582 158 aa15.14■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 XKRXQ6PP77 449 aa15.14■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 CADM3Q8N126 398 aa15.14■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 OR6V1Q8N148 313 aa15.14■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 BMPERQ8N8U9 685 aa15.14■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 OR2T4Q8NH00 348 aa15.14■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 OR8K3Q8NH51 312 aa15.14■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 SMIM19Q96E16 107 aa15.14■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 NEURL2Q9BR09 285 aa15.14■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 SYT4Q9H2B2 425 aa15.14■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 KLRF1Q9NZS2 232 aa15.14■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 MED11Q9P086 117 aa15.14■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 MYOTQ9UBF9 498 aa15.14■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 ANKUB1A6NFN9 424 aa15.14■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 B4DXG7 233 aa15.14■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 OR2J2O76002 312 aa15.14■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 AHSA1O95433 338 aa15.14■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 CFL1P23528 166 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 EDNRAP25101 427 aa15.14■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 HTR3AP46098 478 aa15.14■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 HSF2Q03933 536 aa15.14■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 GDPD3Q7L5L3 318 aa15.14■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 SLC16A9Q7RTY1 509 aa15.14■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 NPAS1Q99742 590 aa15.14■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 INIPQ9NRY2 104 aa15.14■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 VDAC3Q9Y277 283 aa15.14■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 TVP23AA6NH52 213 aa15.13■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 SC5DO75845 299 aa15.13■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 OR6A2O95222 327 aa15.13■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 APOA1P02647 267 aa15.13■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 IL7P13232 177 aa15.13■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 PRKCAP17252 672 aa15.13■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP15.13■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 PYDC2Q56P42 97 aa15.13■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 CNIH2Q6PI25 160 aa15.13■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 PXKQ7Z7A4 578 aa15.13■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 DTWD2Q8NBA8 298 aa15.13■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 TBC1D24Q9ULP9 559 aa15.13■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 EXPH5Q8NEV8 1989 aa15.13■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 XKRYO14609 159 aa15.13■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 NAGAP17050 411 aa15.13■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 ARSKQ6UWY0 536 aa15.13■□□□□ 0.01
TOM1-216ENST00000492723 PM20D2Q8IYS1 436 aa15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms