RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 RAB28P51157 221 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 LUMP51884 338 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 FHL1Q13642 323 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 SERTAD2Q14140 314 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 STAC2Q6ZMT1 411 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 DNM1P46Q6ZS02 220 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 TMED4Q7Z7H5 227 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 CBLN2Q8IUK8 224 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF619Q8N2I2 560 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 COX18Q8N8Q8 333 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM185AQ8NFB2 350 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 RASD2Q96D21 266 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 C10orf90Q96M02 699 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 SPOCK3Q9BQ16 436 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM185BQ9H7F4 350 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 MLXQ9UH92 298 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 A0A1B0GWA3 101 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 GXYLT2A0PJZ3 443 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 IGLON5A6NGN9 336 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 LIPCP11150 499 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 GTF2F2P13984 249 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC6A6P31641 620 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 HSD17B2P37059 387 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 STARP49675 285 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 PRMT2P55345 433 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 GMFBP60983 142 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 DPTQ07507 201 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 POU4F2Q12837 409 aa12.38□□□□□ -0.43
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SH3BP1-206ENST00000469947 OTPQ5XKR4 325 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 SYS1Q8N2H4 156 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 OR2L13Q8N349 312 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF511Q8NB15 262 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 CAMKVQ8NCB2 501 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 KREMEN2Q8NCW0 462 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 TSSK2Q96PF2 358 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 EXO5Q9H790 373 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC39A1Q9NY26 324 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 RASL12Q9NYN1 266 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 ACTR10Q9NZ32 417 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF281Q9Y2X9 895 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 TBC1D3BA6NDS4 549 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 LRRC72A6NJI9 287 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 LDB3O75112 727 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 RBBP9O75884 186 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 MNDAP41218 407 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 RPS27P42677 84 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 LTBQ06643 244 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 PON3Q15166 354 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 DEFB134Q4QY38 66 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF546Q86UE3 836 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 OR2L3Q8NG85 312 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 OR52E1Q8NGJ3 308 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 OR10AC1Q8NH08 325 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 MIB2Q96AX9 1013 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF350Q9GZX5 532 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF337Q9Y3M9 751 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 H7C2Y5 167 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 CCSO14618 274 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 KCNAB3O43448 404 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 GLSO94925 669 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 CD3DP04234 171 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 MPPED2Q15777 294 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 MOB3CQ70IA8 216 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 NDUFAF7Q7L592 441 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 NSMAFQ92636 917 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 COX14Q96I36 57 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 ULBP3Q9BZM4 244 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 FBXO4Q9UKT5 387 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 ICAM5Q9UMF0 924 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 TRPM6Q9BX84 2022 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 A0A1B0GW55 424 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 OR6C68A6NDL8 312 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 F8W036 122 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF254O75437 659 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 F12P00748 615 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 DBIP07108 87 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 DUX4L2P0CJ85 424 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 DUX4L3P0CJ86 424 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 DUX4L4P0CJ87 422 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 DUX4L5P0CJ88 424 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 DUX4L6P0CJ89 424 aa12.36□□□□□ -0.43
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