RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 STARD5Q9NSY2 213 aa7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 GPATCH2Q9NW75 528 aa7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 PILRAQ9UKJ1 303 aa7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 CES1P1Q9UKY3 287 aa7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 J3QLW9 94 aa7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 DIRAS1O95057 198 aa7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 SMIM10L1P0DMW3 83 aa7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 PNMTP11086 282 aa7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 ZNF19P17023 458 aa7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 PRKAR1BP31321 381 aa7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 MTNR1AP48039 350 aa7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 CASP9P55211 416 aa7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 TAS2R31P59538 309 aa7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 CHRNEQ04844 493 aa7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 FOXB2Q5VYV0 432 aa7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 GALNT10Q86SR1 603 aa7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 MMP21Q8N119 569 aa7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 PROKR2Q8NFJ6 384 aa7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 SCARB1Q8WTV0 552 aa7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 THAP4Q8WY91 577 aa7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 ST8SIA4Q92187 359 aa7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 DDIT4LQ96D03 193 aa7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 SMIM10Q96HG1 83 aa7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 OR7D2Q96RA2 312 aa7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 NGBQ9NPG2 151 aa7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 C5AR2Q9P296 337 aa7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 NDRG3Q9UGV2 375 aa7.06□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 NPIPA5E9PKD4 350 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 SLC34A2O95436 690 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 CRYABP02511 175 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 CD34P28906 385 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 SLC6A6P31641 620 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 GNALP38405 381 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 VEGFCP49767 419 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 LUMP51884 338 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 ART1P52961 327 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 OR12D2P58182 307 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 ISL1P61371 349 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 RPS26P62854 115 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 PLP2Q04941 152 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 C3orf33Q6P1S2 294 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 GUSBP11Q6P575 273 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 CEACAM19Q7Z692 300 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 OR4C15Q8NGM1 316 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 FANK1Q8TC84 345 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 GIMAP5Q96F15 307 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 SGCZQ96LD1 299 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 PRRC1Q96M27 445 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 SFXN2Q96NB2 322 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 STACQ99469 402 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 FEVQ99581 238 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 NEURL2Q9BR09 285 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 HDHD5Q9BXW7 423 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 RAB33BQ9H082 229 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 PIGMQ9H3S5 423 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 PLEKHA1Q9HB21 404 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 NIT2Q9NQR4 276 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 UBQLN4Q9NRR5 601 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 C19orf12Q9NSK7 152 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 NPIPA1Q9UND3 350 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 C10orf142B7Z368 130 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 H7C417 338 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 MEN1O00255 615 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 SHOXO15266 292 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 EML2O95834 649 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 HTR1AP08908 422 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 CSF1P09603 554 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 CEACAM1P13688 526 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 ARSBP15848 533 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 SLC2A5P22732 501 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 OR1D4P47884 311 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 GNMTQ14749 295 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 ARL6IP1Q15041 203 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 CYP27C1Q4G0S4 372 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 RAET1LQ5VY80 246 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 C18orf63Q68DL7 685 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 TPRA1Q86W33 373 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 OR9A2Q8NGT5 310 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 OR14L1PQ8NHC6 308 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 FBLIM1Q8WUP2 373 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa7.05□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms