RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465909.2

SOGA3-201, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SOGA3, Length 3,756 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-201ENST00000465909 SIRPAP78324 504 aa13.72□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 RPP30P78346 268 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 SKA3Q8IX90 412 aa13.72□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 OR9A1PQ8NGU1 263 aa13.72□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 OR2M4Q96R27 311 aa13.72□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 ZNF337Q9Y3M9 751 aa13.72□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 PCCBP05166 539 aa13.72□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 C1SP09871 688 aa13.72□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 C12orf40Q86WS4 652 aa13.72□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 NLGN2Q8NFZ4 835 aa13.72□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa13.72□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 CMKLR1Q99788 373 aa13.72□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 EFCAB11Q9BUY7 163 aa13.72□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 SBK2P0C263 348 aa13.72□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa13.72□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 RPS27P42677 84 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 ID2Q02363 134 aa13.72□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 GAMTQ14353 236 aa13.72□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 C11orf87Q6NUJ2 197 aa13.72□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 PPP1R3BQ86XI6 285 aa13.72□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 OR2G2Q8NGZ5 317 aa13.72□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 DMRT3Q9NQL9 472 aa13.72□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 LANCL2Q9NS86 450 aa13.72□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 SLC23A2Q9UGH3 650 aa13.72□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa13.72□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 ARID2Q68CP9 1835 aa13.71□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa13.71□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 DCDC2BA2VCK2 349 aa13.71□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 IFITM5A6NNB3 132 aa13.71□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 LRP3O75074 770 aa13.71□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 OR2F2O95006 317 aa13.71□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 CPN1P15169 458 aa13.71□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 RPA2P15927 270 aa13.71□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 THBS2P35442 1172 aa13.71□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa13.71□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 OR2F1Q13607 317 aa13.71□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 GGTA1PQ4G0N0 100 aa13.71□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 AWAT1Q58HT5 328 aa13.71□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 RNLSQ5VYX0 342 aa13.71□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 POMZP3Q6PJE2 187 aa13.71□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 CXCL17Q6UXB2 119 aa13.71□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 UBTD2Q8WUN7 234 aa13.71□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 HPSE2Q8WWQ2 592 aa13.71□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 MOAP1Q96BY2 351 aa13.71□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 IP6K3Q96PC2 410 aa13.71□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 DNAJB11Q9UBS4 358 aa13.71□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 RCBTB2O95199 551 aa13.71□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 NFATC1O95644 943 aa13.71□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 OR8G3PP0DMU2 310 aa13.71□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 ADCYAP1P18509 176 aa13.71□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 CASRP41180 1078 aa13.71□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 AADACL4Q5VUY2 407 aa13.71□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 TCEAL6Q6IPX3 200 aa13.71□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 LCTLQ6UWM7 567 aa13.71□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 MISPQ8IVT2 679 aa13.71□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 WBP1Q96G27 269 aa13.71□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 FOXN4Q96NZ1 517 aa13.71□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 B4GALT6Q9UBX8 382 aa13.71□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 PISDQ9UG56 409 aa13.71□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 AMDHD2Q9Y303 409 aa13.71□□□□□ -0.21
SOGA3-201ENST00000465909 IMPA2O14732 288 aa13.71□□□□□ -0.22
SOGA3-201ENST00000465909 MBTPS2O43462 519 aa13.71□□□□□ -0.22
SOGA3-201ENST00000465909 MT-ND4LP03901 98 aa13.71□□□□□ -0.22
SOGA3-201ENST00000465909 RNH1P13489 461 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.22
SOGA3-201ENST00000465909 MAOAP21397 527 aa13.71□□□□□ -0.22
SOGA3-201ENST00000465909 RBP2P50120 134 aa13.71□□□□□ -0.22
SOGA3-201ENST00000465909 PNLIPRP2P54317 469 aa13.71□□□□□ -0.22
SOGA3-201ENST00000465909 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.22
SOGA3-201ENST00000465909 PJVKQ0ZLH3 352 aa13.71□□□□□ -0.22
SOGA3-201ENST00000465909 RHEBQ15382 184 aa13.71□□□□□ -0.22
SOGA3-201ENST00000465909 UQCC3Q6UW78 93 aa13.71□□□□□ -0.22
SOGA3-201ENST00000465909 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa13.71□□□□□ -0.22
SOGA3-201ENST00000465909 APCDD1Q8J025 514 aa13.71□□□□□ -0.22
SOGA3-201ENST00000465909 HIST1H2BAQ96A08 127 aa13.71□□□□□ -0.22
SOGA3-201ENST00000465909 CALML5Q9NZT1 146 aa13.71□□□□□ -0.22
SOGA3-201ENST00000465909 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.22
SOGA3-201ENST00000465909 DSPPQ9NZW4 1301 aa13.71□□□□□ -0.22
SOGA3-201ENST00000465909 NRAPQ86VF7 1730 aa13.71□□□□□ -0.22
SOGA3-201ENST00000465909 BPTFQ12830 3046 aa13.7□□□□□ -0.22
SOGA3-201ENST00000465909 OR2M5A3KFT3 312 aa13.7□□□□□ -0.22
SOGA3-201ENST00000465909 ZNF726A6NNF4 738 aa13.7□□□□□ -0.22
SOGA3-201ENST00000465909 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
SOGA3-201ENST00000465909 OR2C1O95371 312 aa13.7□□□□□ -0.22
SOGA3-201ENST00000465909 CSF1P09603 554 aa13.7□□□□□ -0.22
SOGA3-201ENST00000465909 PI3P19957 117 aa13.7□□□□□ -0.22
SOGA3-201ENST00000465909 MPGP29372 298 aa13.7□□□□□ -0.22
SOGA3-201ENST00000465909 LIMS1P48059 325 aa13.7□□□□□ -0.22
SOGA3-201ENST00000465909 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
SOGA3-201ENST00000465909 C1orf189Q5VU69 101 aa13.7□□□□□ -0.22
SOGA3-201ENST00000465909 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
SOGA3-201ENST00000465909 PFN4Q8NHR9 129 aa13.7□□□□□ -0.22
SOGA3-201ENST00000465909 FAM46BQ96A09 425 aa13.7□□□□□ -0.22
SOGA3-201ENST00000465909 TGM7Q96PF1 710 aa13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms