RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 NPPAP01160 153 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF43P17038 809 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF83P51522 516 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 CDH12P55289 794 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 SLC25A3Q00325 362 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 LTBQ06643 244 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 MFSD13AQ14CX5 517 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 ETFDHQ16134 617 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 NRF1Q16656 503 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 CYP51A1Q16850 503 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 MS4A18Q3C1V0 323 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 COQ5Q5HYK3 327 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 C9orf135Q5VTT2 229 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 NANOGP8Q6NSW7 305 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 NIPAL3Q6P499 406 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF613Q6PF04 617 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 NHLRC1Q6VVB1 395 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 CCDC80Q76M96 950 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 LINGO2Q7L985 606 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 SMYD1Q8NB12 490 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 OR10A6Q8NH74 314 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 SH3GL1Q99961 368 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM43Q9BTV4 400 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 NANOGQ9H9S0 305 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 OBP2BQ9NPH6 170 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 FAIMQ9NVQ4 179 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 ARMCX1Q9P291 453 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 SEC14L4Q9UDX3 406 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 SLC13A4Q9UKG4 626 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 TRIM64A6NGJ6 449 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 TRIM64BA6NI03 449 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 B2RBV5 119 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 M0R082 166 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 UPK3AO75631 287 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 GRPRP30550 384 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 TTKP33981 857 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 CLDN17P56750 224 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 MXRA7P84157 204 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 KLF10Q13118 480 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 SNCBQ16143 134 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 VMACQ2NL98 169 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 CALHM3Q86XJ0 350 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 DEPDC4Q8N2C3 294 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 SCAIQ8N9R8 606 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 OR6T1Q8NGN1 323 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 OR1K1Q8NGR3 316 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF417Q8TAU3 575 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 LRRC58Q96CX6 371 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 EPYCQ99645 322 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 MCHR1Q99705 422 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 DHRS9Q9BPW9 319 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 SELENONQ9NZV5 590 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 CORINQ9Y5Q5 1042 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF587BE7ETH6 402 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 M0R1B8 84 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 FXYD1O00168 92 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 CIB2O75838 187 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 KRT33AO76009 404 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 LYPD3O95274 346 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 LY6G6DO95868 133 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 WNT11O96014 354 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 BGLAPP02818 100 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 HEXAP06865 529 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 CD247P20963 164 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 PCGF2P35227 344 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 CDKN1AP38936 164 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 CRYBA2P53672 197 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 CDH11P55287 796 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 LGALS3BPQ08380 585 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 NPTX1Q15818 432 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 TBRG1Q3YBR2 411 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 AGAP6Q5VW22 663 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 C11orf71Q6IPW1 123 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 SLC22A25Q6T423 547 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 CLEC9AQ6UXN8 241 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 DNM1P46Q6ZS02 220 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 TREML1Q86YW5 311 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 FAM169BQ8N8A8 192 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 OR8J3Q8NGG0 315 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 OR4D11Q8NGI4 311 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 TAMM41Q96BW9 452 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 PCDHAC1Q9H158 963 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 TAS2R1Q9NYW7 299 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-210ENST00000462125 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 277.2 ms