RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460331.5

ZNF3-211, Transcript of zinc finger protein 3, human

TSL 4

Gene ZNF3, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF3-211	ENST00000460331	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331		H0YAE9	185 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	ARPC3	O15145	178 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	SERPINI2	O75830	405 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	SNAP29	O95721	258 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	F13B	P05160	661 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	ACVR2A	P27037	513 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	CDK5	Q00535	292 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	FHL1	Q13642	323 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	SLC17A1	Q14916	467 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	EMC4	Q5J8M3	183 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	CASP12	Q6UXS9	341 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	KDM8	Q8N371	416 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	CYGB	Q8WWM9	190 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331		Q9H521	79 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	FRY	Q5TBA9	3013 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331		A6NIZ1	184 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	ZNF726	A6NNF4	738 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	ZAR1L	A6NP61	321 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	ZNF724	A8MTY0	619 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	BHLHE40	O14503	412 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	XKRY	O14609	159 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	SLC16A6	O15403	523 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	ZNHIT1	O43257	154 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	PPP1R3D	O95685	299 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	IFNG	P01579	166 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	IGHM	P01871	453 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	GRK5	P34947	590 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	SLC16A1	P53985	500 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	AQP4	P55087	323 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	PER3	P56645	1201 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	FXYD6P3	P58550	94 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	CDC42	P60953	191 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	RAP1B	P61224	184 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	RAP1A	P62834	184 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	ERVK-25	P63136	954 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	MYBPC1	Q00872	1141 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	KEAP1	Q14145	624 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	PGGHG	Q32M88	737 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	LNX2	Q8N448	690 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	MBOAT4	Q96T53	435 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	APOL4	Q9BPW4	351 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	ADI1	Q9BV57	179 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	RAB26	Q9ULW5	256 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	MPDZ	O75970	2070 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
ZNF3-211	ENST00000460331	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63

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