RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 BSGP35613 385 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 RPIAP49247 311 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 RAG2P55895 527 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 WNT4P56705 351 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 SH3BP2P78314 561 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 PYY3Q5JQD4 70 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 DNLZQ5SXM8 178 aa5.19□□□□□ -1.58
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PTPRC-209ENST00000442510 STAG3L4Q8TBR4 150 aa5.19□□□□□ -1.58
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PTPRC-209ENST00000442510 RDH14Q9HBH5 336 aa5.19□□□□□ -1.58
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PTPRC-209ENST00000442510 HES4Q9HCC6 221 aa5.19□□□□□ -1.58
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PTPRC-209ENST00000442510 RCBTB2O95199 551 aa5.19□□□□□ -1.58
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PTPRC-209ENST00000442510 SYT12Q8IV01 421 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 CMTM4Q8IZR5 234 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 SMIM20Q8N5G0 67 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 OR5AK3PQ8NH89 298 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 SCGB1C1Q8TD33 95 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa5.19□□□□□ -1.58
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PTPRC-209ENST00000442510 GTSF1LQ9H1H1 148 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
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PTPRC-209ENST00000442510 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 PCTPQ9UKL6 214 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
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PTPRC-209ENST00000442510 EPORP19235 508 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 SLC6A12P48065 614 aa5.19□□□□□ -1.58
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PTPRC-209ENST00000442510 ST8SIA6P61647 398 aa5.19□□□□□ -1.58
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PTPRC-209ENST00000442510 DACT2Q5SW24 774 aa5.19□□□□□ -1.58
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PTPRC-209ENST00000442510 ABRAQ8N0Z2 381 aa5.19□□□□□ -1.58
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PTPRC-209ENST00000442510 ZNF676Q8N7Q3 588 aa5.19□□□□□ -1.58
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PTPRC-209ENST00000442510 OR5A2Q8NGI9 324 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 OR8J1Q8NGP2 316 aa5.19□□□□□ -1.58
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PTPRC-209ENST00000442510 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 HPRT1P00492 218 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 SOD3P08294 240 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 GSTM3P21266 225 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 EDNRAP25101 427 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 ACVR1BP36896 505 aa5.18□□□□□ -1.58
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