RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441703.5

HDAC6-210, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC6, Length 599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-210ENST00000441703 AIPO00170 330 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 TNFRSF11BO00300 401 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 GATCO43716 136 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 APOL3O95236 402 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 ECDO95905 644 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 OTCP00480 354 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 RPN2P04844 631 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 IFNA4P05014 189 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 SULT1A3P0DMM9 295 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 SULT1A4P0DMN0 295 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 CFPP27918 469 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 SOX18P35713 384 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 INPP1P49441 399 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 AGTR2P50052 363 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 NUDT6P53370 316 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 ATP5J2P56134 94 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 PPIAP62937 165 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 KCNJ10P78508 379 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 TPBGQ13641 420 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 GPR176Q14439 515 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 FGFBP1Q14512 234 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 SF1Q15637 639 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 SYTL3Q4VX76 610 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 SPIN4Q56A73 249 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 IGSF11Q5DX21 431 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 RTL6Q6ICC9 239 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 CNIH2Q6PI25 160 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 PAQR3Q6TCH7 311 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 LANCL3Q6ZV70 420 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 PTCHD4Q6ZW05 846 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 MILR1Q7Z6M3 343 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 CMIPQ8IY22 773 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 OR4N4Q8N0Y3 316 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 STPG2Q8N412 459 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 CAMKVQ8NCB2 501 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 OR10G2Q8NGC3 310 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 OR8D4Q8NGM9 314 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 OR13C4Q8NGS5 318 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 OR8K3Q8NH51 312 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 TMEM171Q8WVE6 324 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 ACOT12Q8WYK0 555 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 RIT1Q92963 219 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 SARAFQ96BY9 339 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 HSH2DQ96JZ2 352 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 SLC38A2Q96QD8 506 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 FEVQ99581 238 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 C12orf57Q99622 126 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 H2AFJQ9BTM1 129 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 VN1R1Q9GZP7 353 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 FN3KQ9H479 309 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 AMBNQ9NP70 447 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 COPZ2Q9P299 210 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 MBD2Q9UBB5 411 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 NDRG3Q9UGV2 375 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 PFDN2Q9UHV9 154 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 CRYL1Q9Y2S2 319 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 COMMD10Q9Y6G5 202 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa5.84□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 IRGMA1A4Y4 181 aa5.84□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 SERTM1A2A2V5 107 aa5.84□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 CDC7O00311 574 aa5.84□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 OR7A17O14581 309 aa5.84□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 SLC16A5O15375 505 aa5.84□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 SELENOFO60613 162 aa5.84□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 CFDP00746 253 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 ADRA2AP08913 450 aa5.84□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 GALP22466 123 aa5.84□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 PPIBP23284 216 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 PRPH2P23942 346 aa5.84□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 MC4RP32245 332 aa5.84□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 THBS2P35442 1172 aa5.84□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 IDH2P48735 452 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 MEOX2P50222 304 aa5.84□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 HTR6P50406 440 aa5.84□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 RAB13P51153 203 aa5.84□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 CRISP1P54107 249 aa5.84□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 SSTP61278 116 aa5.84□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 PLIN5Q00G26 463 aa5.84□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 DEFA6Q01524 100 aa5.84□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 GTF2H2Q13888 395 aa5.84□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 C1DQ13901 141 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 OPCMLQ14982 345 aa5.84□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 OCLNQ16625 522 aa5.84□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 CLEC12BQ2HXU8 276 aa5.84□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 GTDC1Q4AE62 458 aa5.84□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 SLC25A30Q5SVS4 291 aa5.84□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa5.84□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
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