RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 TUBGCP3Q96CW5 907 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNAJA3Q96EY1 480 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 C14orf79Q96F83 325 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 C16orf58Q96GQ5 468 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 MARK4Q96L34 752 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 FCRL1Q96LA6 429 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNF145Q96MT1 663 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 C7orf26Q96N11 449 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 PINK1Q9BXM7 581 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 LIME1Q9H400 295 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 REEP4Q9H6H4 257 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAP6D1Q9H9H5 199 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACKR4Q9NPB9 350 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLCF1Q9UBD9 225 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 HSPB7Q9UBY9 170 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 AASSQ9UDR5 926 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLEC4AQ9UMR7 237 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCL27Q9Y4X3 112 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 USF3Q68DE3 2245 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 CUBNO60494 3623 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 NAV3Q8IVL0 2385 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 NF1P21359 2839 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1W2PNV4 684 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR2M5A3KFT3 312 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 CBY3A6NI87 242 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 CD8B2A6NJW9 211 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM114B3SHH9 223 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 TNFSF11O14788 317 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 LDLRAD4O15165 306 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 TO15178 435 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 HCRTR2O43614 444 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 TYROBPO43914 113 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANGPTL1O95841 491 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 EPPINO95925 133 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACTL6AO96019 429 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 C1QCP02747 245 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 BPGMP07738 259 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 LAMP1P11279 417 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 G6PDP11413 515 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBL4AP11441 157 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRPS2P11908 318 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 HPGDP15428 266 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF708P17019 499 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 NAGAP17050 411 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 SHC1P29353 583 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 PNLIPRP2P54317 469 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 B3GALT5-AS1P59052 145 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 FOXF1Q12946 379 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 SNTA1Q13424 505 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDE7AQ13946 482 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIAA0040Q15053 153 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 PON3Q15166 354 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 IL23RQ5VWK5 629 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 MORN5Q5VZ52 161 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR4F3Q6IEY1 312 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 APOOLQ6UXV4 268 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF550Q7Z398 422 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 NUDCD3Q8IVD9 361 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM185AQ8N0U4 392 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 FADS6Q8N9I5 356 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACBD4Q8NC06 268 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR4A15Q8NGL6 344 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM76AQ8TAV0 307 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 FNDC9Q8TBE3 224 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 DUSP19Q8WTR2 217 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 ERP27Q96DN0 273 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 GIMAP5Q96F15 307 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC35G5Q96KT7 338 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLHL15Q96M94 604 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZIM3Q96PE6 472 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 PIGQQ9BRB3 760 aa3.94□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms