RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428858.1

TTC28-AS1-209, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 565 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TAS2R5Q9NYW4 299 aa7.27□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EMC3Q9P0I2 261 aa7.27□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SEC14L4Q9UDX3 406 aa7.27□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 Q9UFV3 132 aa7.27□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RNF6Q9Y252 685 aa7.27□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EFCAB9A8MZ26 197 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MS4A18H0YCH9 400 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GNGT2O14610 69 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR10H3O60404 316 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PLGP00747 810 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LDLRP01130 860 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CGAP01215 116 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HIST1H2ABP04908 130 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 YES1P07947 543 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CCDC159P0C7I6 412 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CBLP22681 906 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AGTR1P30556 359 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CHRNB4P30926 498 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 UQCRC1P31930 480 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OPRM1P35372 400 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GSSP48637 474 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TUBA1BP68363 451 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC34A1Q06495 639 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FOXF2Q12947 444 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RCN1Q15293 331 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MS4A18Q3C1V0 323 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMEM225Q6GV28 225 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PPP4R4Q6NUP7 873 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NHLRC1Q6VVB1 395 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TUBA1AQ71U36 451 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EPHX4Q8IUS5 362 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TUSC5Q8IXB3 177 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR10G2Q8NGC3 310 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR9K2Q8NGE7 335 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR6K3Q8NGY3 331 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ASB5Q8WWX0 329 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 STMN2Q93045 179 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HIST1H2ACQ93077 130 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMEM45BQ96B21 275 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OXGR1Q96P68 337 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GPA33Q99795 319 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BDH2Q9BUT1 245 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PIGMQ9H3S5 423 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 S100A14Q9HCY8 104 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 COQ3Q9NZJ6 369 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EMC9Q9Y3B6 208 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 U3KQV3 271 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SHANK1Q9Y566 2161 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 POLEQ07864 2286 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 UNC119BA6NIH7 251 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NPIPB13A6NJU9 1138 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NPIPB4C9JG80 1138 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DVL2O14641 736 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IDH3BO43837 385 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZG16O60844 167 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR6A2O95222 327 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HPRP00739 348 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ADAP00813 363 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GASTP01350 101 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ADORA3P0DMS8 318 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SAGP10523 405 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CD8BP10966 210 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GPR4P46093 362 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PCYT1AP49585 367 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ARHGDIAP52565 204 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IST1P53990 364 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PRPS1P60891 318 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TSPAN31Q12999 210 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SPCS2Q15005 226 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZBED5Q49AG3 693 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMEM201Q5SNT2 666 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HMBOX1Q6NT76 420 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 XKRXQ6PP77 449 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TFAP2EQ6VUC0 442 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CREB3L2Q70SY1 520 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GALNT5Q7Z7M9 940 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MRGPRGQ86SM5 289 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OAFQ86UD1 273 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GPAT4Q86UL3 456 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HIPK1Q86Z02 1210 aa7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms