RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 SLAMF8Q9P0V8 285 aa18.25■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 KLHL14Q9P2G3 628 aa18.25■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 SEC14L4Q9UDX3 406 aa18.25■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 FBN3Q75N90 2809 aa18.25■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 PRORSD1PA6NEY8 169 aa18.24■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 M0R082 166 aa18.24■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 FAM157CP0CG43 387 aa18.24■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 GPX2P18283 190 aa18.24■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 USF1P22415 310 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 PDLIM4P50479 330 aa18.24■□□□□ 0.51
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LIMS1-208ENST00000428064 ADIPOQQ15848 244 aa18.24■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 COMTD1Q86VU5 262 aa18.24■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC36Q8IYA8 594 aa18.24■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 PIK3C3Q8NEB9 887 aa18.24■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF417Q8TAU3 575 aa18.24■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC8CQ8TDW0 803 aa18.24■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 SLC41A3Q96GZ6 507 aa18.24■□□□□ 0.51
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LIMS1-208ENST00000428064 EBF4Q9BQW3 602 aa18.24■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 PLK3Q9H4B4 646 aa18.24■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF442Q9H7R0 627 aa18.24■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 CORINQ9Y5Q5 1042 aa18.24■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 A0A087WUJ7 227 aa18.23■□□□□ 0.51
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LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PPZ6 126 aa18.23■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 NR5A2O00482 541 aa18.23■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 CBR1P16152 277 aa18.23■□□□□ 0.51
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LIMS1-208ENST00000428064 C1DQ13901 141 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
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LIMS1-208ENST00000428064 TMEM123Q8N131 208 aa18.23■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 GPR137CQ8N3F9 429 aa18.23■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 SCAIQ8N9R8 606 aa18.23■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 STON2Q8WXE9 905 aa18.23■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 SLC47A1Q96FL8 570 aa18.23■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 OR2M2Q96R28 347 aa18.23■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 GPR35Q9HC97 309 aa18.23■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa18.23■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 LPAR3Q9UBY5 353 aa18.23■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 ALPK2Q86TB3 2170 aa18.23■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 A0A0B4J2E0 115 aa18.22■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1B0GX12 115 aa18.22■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 LY6HO94772 140 aa18.22■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV4-31P0DP07 118 aa18.22■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 CALCRP30988 508 aa18.22■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 ARR3P36575 388 aa18.22■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 NCALDP61601 193 aa18.22■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP18.22■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 ARF1P84077 181 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 SCARB2Q14108 478 aa18.22■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa18.22■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF607Q96SK3 696 aa18.22■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 EPYCQ99645 322 aa18.22■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 PIMREGQ9BSJ6 248 aa18.22■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 IKZF5Q9H5V7 419 aa18.22■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 CRLF2Q9HC73 371 aa18.22■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa18.21■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 EVPLLA8MZ36 301 aa18.21■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 TPST1O60507 370 aa18.21■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 SERPINB7O75635 380 aa18.21■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 OR4A8P0C604 315 aa18.21■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 SLC6A2P23975 617 aa18.21■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 NR4A2P43354 598 aa18.21■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 GZMKP49863 264 aa18.21■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 TUBA1BP68363 451 aa18.21■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 TUBA4AP68366 448 aa18.21■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 CEACAM16Q2WEN9 425 aa18.21■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 TUBA1AQ71U36 451 aa18.21■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF627Q7L945 461 aa18.21■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa18.21■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 HIPK4Q8NE63 616 aa18.21■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 LRR1Q96L50 414 aa18.21■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 KCNK17Q96T54 332 aa18.21■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 SELENONQ9NZV5 590 aa18.21■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 MS4A18H0YCH9 400 aa18.2■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 AQP5P55064 265 aa18.2■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 HGFACQ04756 655 aa18.2■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 SQLEQ14534 574 aa18.2■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 ADRM1Q16186 407 aa18.2■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 MS4A18Q3C1V0 323 aa18.2■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 UEVLDQ8IX04 471 aa18.2■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 IL17RDQ8NFM7 739 aa18.2■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM43Q9BTV4 400 aa18.2■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 SEC61A2Q9H9S3 476 aa18.2■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM27Q9HBJ8 222 aa18.2■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 FMO6PO60774 539 aa18.19■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 BGLAPP02818 100 aa18.19■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 NQO1P15559 274 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 THBS2P35442 1172 aa18.19■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 OR1Q1Q15612 314 aa18.19■□□□□ 0.5
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